Protein–RNA interactions for Protein: Q15464

SHB, SH2 domain-containing adapter protein B, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHBQ15464 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SHBQ15464 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SHBQ15464 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SHBQ15464 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SHBQ15464 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SHBQ15464 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SHBQ15464 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SHBQ15464 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SHBQ15464 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SHBQ15464 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SHBQ15464 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SHBQ15464 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SHBQ15464 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SHBQ15464 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SHBQ15464 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
SHBQ15464 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SHBQ15464 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SHBQ15464 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SHBQ15464 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SHBQ15464 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SHBQ15464 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SHBQ15464 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
SHBQ15464 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SHBQ15464 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SHBQ15464 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
SHBQ15464 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SHBQ15464 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SHBQ15464 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SHBQ15464 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SHBQ15464 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SHBQ15464 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SHBQ15464 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SHBQ15464 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SHBQ15464 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SHBQ15464 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
SHBQ15464 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SHBQ15464 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SHBQ15464 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SHBQ15464 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SHBQ15464 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SHBQ15464 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SHBQ15464 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SHBQ15464 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SHBQ15464 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SHBQ15464 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SHBQ15464 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SHBQ15464 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SHBQ15464 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SHBQ15464 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SHBQ15464 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SHBQ15464 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SHBQ15464 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SHBQ15464 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SHBQ15464 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SHBQ15464 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SHBQ15464 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SHBQ15464 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SHBQ15464 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SHBQ15464 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SHBQ15464 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
SHBQ15464 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
SHBQ15464 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
SHBQ15464 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SHBQ15464 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SHBQ15464 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SHBQ15464 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SHBQ15464 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SHBQ15464 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SHBQ15464 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SHBQ15464 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SHBQ15464 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SHBQ15464 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SHBQ15464 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SHBQ15464 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SHBQ15464 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SHBQ15464 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SHBQ15464 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SHBQ15464 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SHBQ15464 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SHBQ15464 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SHBQ15464 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SHBQ15464 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SHBQ15464 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SHBQ15464 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SHBQ15464 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SHBQ15464 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SHBQ15464 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SHBQ15464 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SHBQ15464 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SHBQ15464 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SHBQ15464 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
SHBQ15464 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SHBQ15464 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SHBQ15464 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SHBQ15464 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
SHBQ15464 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SHBQ15464 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SHBQ15464 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SHBQ15464 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SHBQ15464 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.4 ms