Protein–RNA interactions for Protein: Q15386

UBE3C, Ubiquitin-protein ligase E3C, humanhuman

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Length 1,083 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3CQ15386 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
UBE3CQ15386 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
UBE3CQ15386 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
UBE3CQ15386 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
UBE3CQ15386 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
UBE3CQ15386 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
UBE3CQ15386 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
UBE3CQ15386 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
UBE3CQ15386 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
UBE3CQ15386 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
UBE3CQ15386 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
UBE3CQ15386 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
UBE3CQ15386 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC20.57■□□□□ 0.88
UBE3CQ15386 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
UBE3CQ15386 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
UBE3CQ15386 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
UBE3CQ15386 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
UBE3CQ15386 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
UBE3CQ15386 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC20.57■□□□□ 0.88
UBE3CQ15386 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC20.57■□□□□ 0.88
UBE3CQ15386 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
UBE3CQ15386 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
UBE3CQ15386 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
UBE3CQ15386 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
UBE3CQ15386 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
UBE3CQ15386 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
UBE3CQ15386 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
UBE3CQ15386 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
UBE3CQ15386 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
UBE3CQ15386 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
UBE3CQ15386 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
UBE3CQ15386 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
UBE3CQ15386 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
UBE3CQ15386 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
UBE3CQ15386 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
UBE3CQ15386 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
UBE3CQ15386 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
UBE3CQ15386 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
UBE3CQ15386 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
UBE3CQ15386 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
UBE3CQ15386 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
UBE3CQ15386 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
UBE3CQ15386 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC20.56■□□□□ 0.88
UBE3CQ15386 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
UBE3CQ15386 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
UBE3CQ15386 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
UBE3CQ15386 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
UBE3CQ15386 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
UBE3CQ15386 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
UBE3CQ15386 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
UBE3CQ15386 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
UBE3CQ15386 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
UBE3CQ15386 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
UBE3CQ15386 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
UBE3CQ15386 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
UBE3CQ15386 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
UBE3CQ15386 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
UBE3CQ15386 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
UBE3CQ15386 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
UBE3CQ15386 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
UBE3CQ15386 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
UBE3CQ15386 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
UBE3CQ15386 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
UBE3CQ15386 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
UBE3CQ15386 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
UBE3CQ15386 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
UBE3CQ15386 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
UBE3CQ15386 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
UBE3CQ15386 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
UBE3CQ15386 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
UBE3CQ15386 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
UBE3CQ15386 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
UBE3CQ15386 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.55■□□□□ 0.88
UBE3CQ15386 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
UBE3CQ15386 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
UBE3CQ15386 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
UBE3CQ15386 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
UBE3CQ15386 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
UBE3CQ15386 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
UBE3CQ15386 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
UBE3CQ15386 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
UBE3CQ15386 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
UBE3CQ15386 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
UBE3CQ15386 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
UBE3CQ15386 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
UBE3CQ15386 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
UBE3CQ15386 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
UBE3CQ15386 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
UBE3CQ15386 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
UBE3CQ15386 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
UBE3CQ15386 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
UBE3CQ15386 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
UBE3CQ15386 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
UBE3CQ15386 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
UBE3CQ15386 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
UBE3CQ15386 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
UBE3CQ15386 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
UBE3CQ15386 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
UBE3CQ15386 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
UBE3CQ15386 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
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