Protein–RNA interactions for Protein: Q15306

IRF4, Interferon regulatory factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF4Q15306 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
IRF4Q15306 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
IRF4Q15306 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
IRF4Q15306 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
IRF4Q15306 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
IRF4Q15306 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
IRF4Q15306 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
IRF4Q15306 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
IRF4Q15306 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
IRF4Q15306 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
IRF4Q15306 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
IRF4Q15306 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
IRF4Q15306 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
IRF4Q15306 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
IRF4Q15306 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
IRF4Q15306 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
IRF4Q15306 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
IRF4Q15306 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
IRF4Q15306 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
IRF4Q15306 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
IRF4Q15306 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
IRF4Q15306 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
IRF4Q15306 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
IRF4Q15306 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
IRF4Q15306 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
IRF4Q15306 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
IRF4Q15306 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
IRF4Q15306 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
IRF4Q15306 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
IRF4Q15306 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
IRF4Q15306 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
IRF4Q15306 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
IRF4Q15306 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
IRF4Q15306 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
IRF4Q15306 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
IRF4Q15306 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
IRF4Q15306 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
IRF4Q15306 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
IRF4Q15306 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
IRF4Q15306 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
IRF4Q15306 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
IRF4Q15306 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
IRF4Q15306 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
IRF4Q15306 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
IRF4Q15306 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
IRF4Q15306 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
IRF4Q15306 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
IRF4Q15306 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
IRF4Q15306 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
IRF4Q15306 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
IRF4Q15306 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
IRF4Q15306 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
IRF4Q15306 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
IRF4Q15306 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
IRF4Q15306 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC17■□□□□ 0.31
IRF4Q15306 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
IRF4Q15306 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
IRF4Q15306 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
IRF4Q15306 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
IRF4Q15306 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC17■□□□□ 0.31
IRF4Q15306 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
IRF4Q15306 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
IRF4Q15306 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
IRF4Q15306 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
IRF4Q15306 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC17■□□□□ 0.31
IRF4Q15306 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
IRF4Q15306 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
IRF4Q15306 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
IRF4Q15306 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
IRF4Q15306 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
IRF4Q15306 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
IRF4Q15306 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
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IRF4Q15306 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
IRF4Q15306 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
IRF4Q15306 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
IRF4Q15306 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
IRF4Q15306 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
IRF4Q15306 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
IRF4Q15306 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
IRF4Q15306 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
IRF4Q15306 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
IRF4Q15306 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
IRF4Q15306 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
IRF4Q15306 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
IRF4Q15306 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
IRF4Q15306 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
IRF4Q15306 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
IRF4Q15306 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
IRF4Q15306 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
IRF4Q15306 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
IRF4Q15306 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
IRF4Q15306 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
IRF4Q15306 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
IRF4Q15306 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
IRF4Q15306 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
IRF4Q15306 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
IRF4Q15306 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
IRF4Q15306 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
IRF4Q15306 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
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