Protein–RNA interactions for Protein: Q15198

PDGFRL, Platelet-derived growth factor receptor-like protein, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFRLQ15198 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PDGFRLQ15198 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PDGFRLQ15198 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PDGFRLQ15198 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PDGFRLQ15198 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PDGFRLQ15198 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PDGFRLQ15198 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PDGFRLQ15198 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PDGFRLQ15198 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PDGFRLQ15198 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PDGFRLQ15198 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PDGFRLQ15198 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PDGFRLQ15198 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PDGFRLQ15198 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PDGFRLQ15198 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PDGFRLQ15198 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PDGFRLQ15198 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PDGFRLQ15198 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PDGFRLQ15198 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PDGFRLQ15198 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PDGFRLQ15198 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PDGFRLQ15198 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PDGFRLQ15198 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PDGFRLQ15198 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PDGFRLQ15198 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PDGFRLQ15198 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
PDGFRLQ15198 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PDGFRLQ15198 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PDGFRLQ15198 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PDGFRLQ15198 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PDGFRLQ15198 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PDGFRLQ15198 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PDGFRLQ15198 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PDGFRLQ15198 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PDGFRLQ15198 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PDGFRLQ15198 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PDGFRLQ15198 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PDGFRLQ15198 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
PDGFRLQ15198 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PDGFRLQ15198 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PDGFRLQ15198 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PDGFRLQ15198 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PDGFRLQ15198 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PDGFRLQ15198 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PDGFRLQ15198 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PDGFRLQ15198 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PDGFRLQ15198 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PDGFRLQ15198 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PDGFRLQ15198 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PDGFRLQ15198 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
PDGFRLQ15198 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PDGFRLQ15198 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PDGFRLQ15198 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PDGFRLQ15198 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PDGFRLQ15198 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PDGFRLQ15198 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PDGFRLQ15198 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PDGFRLQ15198 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PDGFRLQ15198 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PDGFRLQ15198 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PDGFRLQ15198 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PDGFRLQ15198 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PDGFRLQ15198 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PDGFRLQ15198 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PDGFRLQ15198 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PDGFRLQ15198 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PDGFRLQ15198 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PDGFRLQ15198 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PDGFRLQ15198 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PDGFRLQ15198 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PDGFRLQ15198 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PDGFRLQ15198 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PDGFRLQ15198 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PDGFRLQ15198 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
PDGFRLQ15198 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PDGFRLQ15198 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PDGFRLQ15198 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PDGFRLQ15198 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PDGFRLQ15198 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PDGFRLQ15198 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PDGFRLQ15198 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PDGFRLQ15198 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PDGFRLQ15198 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PDGFRLQ15198 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PDGFRLQ15198 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PDGFRLQ15198 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PDGFRLQ15198 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PDGFRLQ15198 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PDGFRLQ15198 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PDGFRLQ15198 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PDGFRLQ15198 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PDGFRLQ15198 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PDGFRLQ15198 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PDGFRLQ15198 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PDGFRLQ15198 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PDGFRLQ15198 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PDGFRLQ15198 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
PDGFRLQ15198 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PDGFRLQ15198 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PDGFRLQ15198 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
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