Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

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Length 726 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD3Q15059 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
BRD3Q15059 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
BRD3Q15059 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
BRD3Q15059 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
BRD3Q15059 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
BRD3Q15059 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
BRD3Q15059 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
BRD3Q15059 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
BRD3Q15059 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
BRD3Q15059 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
BRD3Q15059 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
BRD3Q15059 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
BRD3Q15059 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
BRD3Q15059 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
BRD3Q15059 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
BRD3Q15059 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
BRD3Q15059 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
BRD3Q15059 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
BRD3Q15059 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
BRD3Q15059 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
BRD3Q15059 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
BRD3Q15059 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
BRD3Q15059 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
BRD3Q15059 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
BRD3Q15059 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
BRD3Q15059 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
BRD3Q15059 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
BRD3Q15059 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
BRD3Q15059 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
BRD3Q15059 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
BRD3Q15059 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
BRD3Q15059 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
BRD3Q15059 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
BRD3Q15059 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
BRD3Q15059 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
BRD3Q15059 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
BRD3Q15059 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
BRD3Q15059 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
BRD3Q15059 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
BRD3Q15059 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
BRD3Q15059 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
BRD3Q15059 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
BRD3Q15059 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
BRD3Q15059 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
BRD3Q15059 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
BRD3Q15059 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
BRD3Q15059 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
BRD3Q15059 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
BRD3Q15059 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
BRD3Q15059 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
BRD3Q15059 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
BRD3Q15059 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
BRD3Q15059 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
BRD3Q15059 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
BRD3Q15059 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
BRD3Q15059 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
BRD3Q15059 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
BRD3Q15059 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
BRD3Q15059 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
BRD3Q15059 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
BRD3Q15059 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
BRD3Q15059 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
BRD3Q15059 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
BRD3Q15059 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
BRD3Q15059 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
BRD3Q15059 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
BRD3Q15059 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
BRD3Q15059 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
BRD3Q15059 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
BRD3Q15059 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
BRD3Q15059 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
BRD3Q15059 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
BRD3Q15059 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
BRD3Q15059 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
BRD3Q15059 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
BRD3Q15059 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
BRD3Q15059 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
BRD3Q15059 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
BRD3Q15059 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
BRD3Q15059 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
BRD3Q15059 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
BRD3Q15059 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
BRD3Q15059 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
BRD3Q15059 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
BRD3Q15059 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
BRD3Q15059 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
BRD3Q15059 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
BRD3Q15059 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
BRD3Q15059 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
BRD3Q15059 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
BRD3Q15059 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
BRD3Q15059 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
BRD3Q15059 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
BRD3Q15059 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
BRD3Q15059 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
BRD3Q15059 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
BRD3Q15059 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
BRD3Q15059 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
BRD3Q15059 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
BRD3Q15059 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
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