Protein–RNA interactions for Protein: Q15032

R3HDM1, R3H domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,099 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3HDM1Q15032 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
R3HDM1Q15032 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
R3HDM1Q15032 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
R3HDM1Q15032 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
R3HDM1Q15032 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
R3HDM1Q15032 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
R3HDM1Q15032 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
R3HDM1Q15032 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
R3HDM1Q15032 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
R3HDM1Q15032 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
R3HDM1Q15032 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
R3HDM1Q15032 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
R3HDM1Q15032 BOLA3-201ENST00000295326 444 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
R3HDM1Q15032 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
R3HDM1Q15032 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
R3HDM1Q15032 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
R3HDM1Q15032 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
R3HDM1Q15032 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
R3HDM1Q15032 PFDN6-204ENST00000395131 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
R3HDM1Q15032 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
R3HDM1Q15032 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
R3HDM1Q15032 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
R3HDM1Q15032 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
R3HDM1Q15032 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
R3HDM1Q15032 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
R3HDM1Q15032 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
R3HDM1Q15032 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
R3HDM1Q15032 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
R3HDM1Q15032 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
R3HDM1Q15032 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
R3HDM1Q15032 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
R3HDM1Q15032 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
R3HDM1Q15032 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
R3HDM1Q15032 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
R3HDM1Q15032 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
R3HDM1Q15032 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
R3HDM1Q15032 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
R3HDM1Q15032 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
R3HDM1Q15032 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
R3HDM1Q15032 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
R3HDM1Q15032 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
R3HDM1Q15032 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
R3HDM1Q15032 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
R3HDM1Q15032 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
R3HDM1Q15032 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
R3HDM1Q15032 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
R3HDM1Q15032 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
R3HDM1Q15032 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
R3HDM1Q15032 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
R3HDM1Q15032 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
R3HDM1Q15032 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
R3HDM1Q15032 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
R3HDM1Q15032 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
R3HDM1Q15032 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
R3HDM1Q15032 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
R3HDM1Q15032 Z84485.1-202ENST00000499560 1230 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
R3HDM1Q15032 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
R3HDM1Q15032 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
R3HDM1Q15032 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
R3HDM1Q15032 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
R3HDM1Q15032 LINC01233-203ENST00000601708 494 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
R3HDM1Q15032 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
R3HDM1Q15032 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
R3HDM1Q15032 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
R3HDM1Q15032 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
R3HDM1Q15032 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
R3HDM1Q15032 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
R3HDM1Q15032 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
R3HDM1Q15032 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
R3HDM1Q15032 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
R3HDM1Q15032 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
R3HDM1Q15032 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
R3HDM1Q15032 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
R3HDM1Q15032 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
R3HDM1Q15032 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
R3HDM1Q15032 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
R3HDM1Q15032 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
R3HDM1Q15032 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
R3HDM1Q15032 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
R3HDM1Q15032 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
R3HDM1Q15032 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
R3HDM1Q15032 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
R3HDM1Q15032 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
R3HDM1Q15032 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
R3HDM1Q15032 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
R3HDM1Q15032 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
R3HDM1Q15032 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
R3HDM1Q15032 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
R3HDM1Q15032 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
R3HDM1Q15032 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
R3HDM1Q15032 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
R3HDM1Q15032 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
R3HDM1Q15032 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
R3HDM1Q15032 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
R3HDM1Q15032 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
R3HDM1Q15032 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
R3HDM1Q15032 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
R3HDM1Q15032 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
R3HDM1Q15032 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
R3HDM1Q15032 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms