Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHD4Q14839 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CHD4Q14839 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CHD4Q14839 TPT1-AS1-203ENST00000412946 744 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CHD4Q14839 RCAN1-212ENST00000492600 935 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CHD4Q14839 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CHD4Q14839 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CHD4Q14839 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CHD4Q14839 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CHD4Q14839 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CHD4Q14839 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CHD4Q14839 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CHD4Q14839 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CHD4Q14839 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CHD4Q14839 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CHD4Q14839 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CHD4Q14839 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CHD4Q14839 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CHD4Q14839 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC21.33■■□□□ 1
CHD4Q14839 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
CHD4Q14839 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC21.33■■□□□ 1
CHD4Q14839 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1
CHD4Q14839 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC21.33■■□□□ 1
CHD4Q14839 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC21.33■■□□□ 1
CHD4Q14839 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
CHD4Q14839 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1
CHD4Q14839 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
CHD4Q14839 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CHD4Q14839 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
CHD4Q14839 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CHD4Q14839 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CHD4Q14839 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CHD4Q14839 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CHD4Q14839 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CHD4Q14839 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CHD4Q14839 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CHD4Q14839 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CHD4Q14839 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CHD4Q14839 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
CHD4Q14839 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CHD4Q14839 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CHD4Q14839 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CHD4Q14839 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CHD4Q14839 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CHD4Q14839 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CHD4Q14839 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CHD4Q14839 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CHD4Q14839 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CHD4Q14839 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CHD4Q14839 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CHD4Q14839 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CHD4Q14839 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CHD4Q14839 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CHD4Q14839 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CHD4Q14839 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CHD4Q14839 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CHD4Q14839 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CHD4Q14839 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CHD4Q14839 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CHD4Q14839 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CHD4Q14839 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CHD4Q14839 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CHD4Q14839 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CHD4Q14839 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CHD4Q14839 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CHD4Q14839 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CHD4Q14839 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CHD4Q14839 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CHD4Q14839 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CHD4Q14839 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CHD4Q14839 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CHD4Q14839 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CHD4Q14839 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CHD4Q14839 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CHD4Q14839 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CHD4Q14839 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CHD4Q14839 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CHD4Q14839 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CHD4Q14839 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CHD4Q14839 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CHD4Q14839 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CHD4Q14839 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CHD4Q14839 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CHD4Q14839 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CHD4Q14839 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CHD4Q14839 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
CHD4Q14839 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CHD4Q14839 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CHD4Q14839 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CHD4Q14839 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CHD4Q14839 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CHD4Q14839 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CHD4Q14839 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CHD4Q14839 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CHD4Q14839 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
CHD4Q14839 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
CHD4Q14839 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CHD4Q14839 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CHD4Q14839 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CHD4Q14839 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
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