Protein–RNA interactions for Protein: Q14264

ERV3-1, Endogenous retrovirus group 3 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERV3-1Q14264 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ERV3-1Q14264 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ERV3-1Q14264 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ERV3-1Q14264 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ERV3-1Q14264 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ERV3-1Q14264 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ERV3-1Q14264 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ERV3-1Q14264 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ERV3-1Q14264 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ERV3-1Q14264 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ERV3-1Q14264 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ERV3-1Q14264 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ERV3-1Q14264 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ERV3-1Q14264 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ERV3-1Q14264 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ERV3-1Q14264 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ERV3-1Q14264 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ERV3-1Q14264 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ERV3-1Q14264 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ERV3-1Q14264 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ERV3-1Q14264 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ERV3-1Q14264 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ERV3-1Q14264 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ERV3-1Q14264 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ERV3-1Q14264 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ERV3-1Q14264 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ERV3-1Q14264 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ERV3-1Q14264 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ERV3-1Q14264 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ERV3-1Q14264 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ERV3-1Q14264 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ERV3-1Q14264 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ERV3-1Q14264 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
ERV3-1Q14264 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
ERV3-1Q14264 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
ERV3-1Q14264 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
ERV3-1Q14264 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
ERV3-1Q14264 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ERV3-1Q14264 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ERV3-1Q14264 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ERV3-1Q14264 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ERV3-1Q14264 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ERV3-1Q14264 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ERV3-1Q14264 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ERV3-1Q14264 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ERV3-1Q14264 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ERV3-1Q14264 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ERV3-1Q14264 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ERV3-1Q14264 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ERV3-1Q14264 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ERV3-1Q14264 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ERV3-1Q14264 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ERV3-1Q14264 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ERV3-1Q14264 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ERV3-1Q14264 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ERV3-1Q14264 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ERV3-1Q14264 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ERV3-1Q14264 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ERV3-1Q14264 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ERV3-1Q14264 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ERV3-1Q14264 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ERV3-1Q14264 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ERV3-1Q14264 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ERV3-1Q14264 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ERV3-1Q14264 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ERV3-1Q14264 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ERV3-1Q14264 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ERV3-1Q14264 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ERV3-1Q14264 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ERV3-1Q14264 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ERV3-1Q14264 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ERV3-1Q14264 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ERV3-1Q14264 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ERV3-1Q14264 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ERV3-1Q14264 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ERV3-1Q14264 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ERV3-1Q14264 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ERV3-1Q14264 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ERV3-1Q14264 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ERV3-1Q14264 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ERV3-1Q14264 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ERV3-1Q14264 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ERV3-1Q14264 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ERV3-1Q14264 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ERV3-1Q14264 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ERV3-1Q14264 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ERV3-1Q14264 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ERV3-1Q14264 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ERV3-1Q14264 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ERV3-1Q14264 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ERV3-1Q14264 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ERV3-1Q14264 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ERV3-1Q14264 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ERV3-1Q14264 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ERV3-1Q14264 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ERV3-1Q14264 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ERV3-1Q14264 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ERV3-1Q14264 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ERV3-1Q14264 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ERV3-1Q14264 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
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