Protein–RNA interactions for Protein: Q14031

COL4A6, Collagen alpha-6(IV) chain, humanhuman

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Length 1,691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A6Q14031 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
COL4A6Q14031 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
COL4A6Q14031 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
COL4A6Q14031 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
COL4A6Q14031 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
COL4A6Q14031 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
COL4A6Q14031 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
COL4A6Q14031 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
COL4A6Q14031 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
COL4A6Q14031 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
COL4A6Q14031 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
COL4A6Q14031 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
COL4A6Q14031 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
COL4A6Q14031 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
COL4A6Q14031 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
COL4A6Q14031 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
COL4A6Q14031 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
COL4A6Q14031 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
COL4A6Q14031 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
COL4A6Q14031 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
COL4A6Q14031 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
COL4A6Q14031 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
COL4A6Q14031 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
COL4A6Q14031 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
COL4A6Q14031 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
COL4A6Q14031 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
COL4A6Q14031 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
COL4A6Q14031 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
COL4A6Q14031 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
COL4A6Q14031 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
COL4A6Q14031 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
COL4A6Q14031 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
COL4A6Q14031 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
COL4A6Q14031 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
COL4A6Q14031 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
COL4A6Q14031 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
COL4A6Q14031 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
COL4A6Q14031 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
COL4A6Q14031 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
COL4A6Q14031 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
COL4A6Q14031 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
COL4A6Q14031 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
COL4A6Q14031 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
COL4A6Q14031 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
COL4A6Q14031 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
COL4A6Q14031 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
COL4A6Q14031 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
COL4A6Q14031 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
COL4A6Q14031 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
COL4A6Q14031 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
COL4A6Q14031 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
COL4A6Q14031 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
COL4A6Q14031 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
COL4A6Q14031 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
COL4A6Q14031 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
COL4A6Q14031 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
COL4A6Q14031 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
COL4A6Q14031 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
COL4A6Q14031 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
COL4A6Q14031 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
COL4A6Q14031 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
COL4A6Q14031 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
COL4A6Q14031 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
COL4A6Q14031 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
COL4A6Q14031 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
COL4A6Q14031 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
COL4A6Q14031 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
COL4A6Q14031 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
COL4A6Q14031 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
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COL4A6Q14031 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
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COL4A6Q14031 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
COL4A6Q14031 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
COL4A6Q14031 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
COL4A6Q14031 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
COL4A6Q14031 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
COL4A6Q14031 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
COL4A6Q14031 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
COL4A6Q14031 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
COL4A6Q14031 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
COL4A6Q14031 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
COL4A6Q14031 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
COL4A6Q14031 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
COL4A6Q14031 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
COL4A6Q14031 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
COL4A6Q14031 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
COL4A6Q14031 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
COL4A6Q14031 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
COL4A6Q14031 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
COL4A6Q14031 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
COL4A6Q14031 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
COL4A6Q14031 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
COL4A6Q14031 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
COL4A6Q14031 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
COL4A6Q14031 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
COL4A6Q14031 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
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