Protein–RNA interactions for Protein: Q13838

DDX39B, Spliceosome RNA helicase DDX39B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39BQ13838 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
DDX39BQ13838 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
DDX39BQ13838 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
DDX39BQ13838 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
DDX39BQ13838 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
DDX39BQ13838 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
DDX39BQ13838 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
DDX39BQ13838 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
DDX39BQ13838 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
DDX39BQ13838 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DDX39BQ13838 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DDX39BQ13838 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DDX39BQ13838 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DDX39BQ13838 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DDX39BQ13838 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DDX39BQ13838 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
DDX39BQ13838 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
DDX39BQ13838 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
DDX39BQ13838 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
DDX39BQ13838 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DDX39BQ13838 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DDX39BQ13838 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DDX39BQ13838 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DDX39BQ13838 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DDX39BQ13838 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
DDX39BQ13838 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
DDX39BQ13838 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
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DDX39BQ13838 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
DDX39BQ13838 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
DDX39BQ13838 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
DDX39BQ13838 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
DDX39BQ13838 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DDX39BQ13838 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
DDX39BQ13838 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
DDX39BQ13838 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DDX39BQ13838 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DDX39BQ13838 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
DDX39BQ13838 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DDX39BQ13838 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DDX39BQ13838 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
DDX39BQ13838 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DDX39BQ13838 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DDX39BQ13838 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
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DDX39BQ13838 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DDX39BQ13838 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DDX39BQ13838 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
DDX39BQ13838 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DDX39BQ13838 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DDX39BQ13838 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DDX39BQ13838 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DDX39BQ13838 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
DDX39BQ13838 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DDX39BQ13838 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
DDX39BQ13838 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
DDX39BQ13838 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
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DDX39BQ13838 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
DDX39BQ13838 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
DDX39BQ13838 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DDX39BQ13838 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
DDX39BQ13838 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
DDX39BQ13838 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
DDX39BQ13838 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
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DDX39BQ13838 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
DDX39BQ13838 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
DDX39BQ13838 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DDX39BQ13838 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
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DDX39BQ13838 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DDX39BQ13838 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DDX39BQ13838 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
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DDX39BQ13838 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DDX39BQ13838 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
DDX39BQ13838 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DDX39BQ13838 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
DDX39BQ13838 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
DDX39BQ13838 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
DDX39BQ13838 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
DDX39BQ13838 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
DDX39BQ13838 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
DDX39BQ13838 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
DDX39BQ13838 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
DDX39BQ13838 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
DDX39BQ13838 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
DDX39BQ13838 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
DDX39BQ13838 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
DDX39BQ13838 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
DDX39BQ13838 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
DDX39BQ13838 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
DDX39BQ13838 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
DDX39BQ13838 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
DDX39BQ13838 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
DDX39BQ13838 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
DDX39BQ13838 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
DDX39BQ13838 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
DDX39BQ13838 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
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