Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

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Length 1,447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTCH1Q13635 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTCH1Q13635 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTCH1Q13635 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTCH1Q13635 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTCH1Q13635 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTCH1Q13635 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTCH1Q13635 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTCH1Q13635 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTCH1Q13635 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTCH1Q13635 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTCH1Q13635 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTCH1Q13635 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTCH1Q13635 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTCH1Q13635 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTCH1Q13635 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTCH1Q13635 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTCH1Q13635 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTCH1Q13635 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTCH1Q13635 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
PTCH1Q13635 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
PTCH1Q13635 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
PTCH1Q13635 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PTCH1Q13635 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PTCH1Q13635 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PTCH1Q13635 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PTCH1Q13635 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PTCH1Q13635 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PTCH1Q13635 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PTCH1Q13635 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
PTCH1Q13635 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PTCH1Q13635 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PTCH1Q13635 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
PTCH1Q13635 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PTCH1Q13635 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PTCH1Q13635 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PTCH1Q13635 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PTCH1Q13635 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PTCH1Q13635 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PTCH1Q13635 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PTCH1Q13635 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PTCH1Q13635 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PTCH1Q13635 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PTCH1Q13635 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PTCH1Q13635 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PTCH1Q13635 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PTCH1Q13635 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PTCH1Q13635 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PTCH1Q13635 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PTCH1Q13635 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PTCH1Q13635 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PTCH1Q13635 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PTCH1Q13635 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PTCH1Q13635 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PTCH1Q13635 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
PTCH1Q13635 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PTCH1Q13635 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
PTCH1Q13635 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PTCH1Q13635 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PTCH1Q13635 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PTCH1Q13635 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PTCH1Q13635 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PTCH1Q13635 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTCH1Q13635 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTCH1Q13635 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTCH1Q13635 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTCH1Q13635 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTCH1Q13635 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTCH1Q13635 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
PTCH1Q13635 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTCH1Q13635 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTCH1Q13635 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTCH1Q13635 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTCH1Q13635 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTCH1Q13635 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTCH1Q13635 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTCH1Q13635 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTCH1Q13635 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTCH1Q13635 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTCH1Q13635 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTCH1Q13635 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTCH1Q13635 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTCH1Q13635 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTCH1Q13635 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTCH1Q13635 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
PTCH1Q13635 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
PTCH1Q13635 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTCH1Q13635 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTCH1Q13635 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
PTCH1Q13635 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTCH1Q13635 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTCH1Q13635 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTCH1Q13635 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTCH1Q13635 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTCH1Q13635 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTCH1Q13635 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTCH1Q13635 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
PTCH1Q13635 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTCH1Q13635 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTCH1Q13635 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
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