Protein–RNA interactions for Protein: Q13616

CUL1, Cullin-1, humanhuman

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Length 776 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL1Q13616 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CUL1Q13616 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CUL1Q13616 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CUL1Q13616 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CUL1Q13616 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CUL1Q13616 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CUL1Q13616 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CUL1Q13616 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CUL1Q13616 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CUL1Q13616 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CUL1Q13616 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CUL1Q13616 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CUL1Q13616 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CUL1Q13616 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CUL1Q13616 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CUL1Q13616 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CUL1Q13616 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CUL1Q13616 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CUL1Q13616 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CUL1Q13616 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CUL1Q13616 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CUL1Q13616 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CUL1Q13616 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CUL1Q13616 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CUL1Q13616 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CUL1Q13616 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CUL1Q13616 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CUL1Q13616 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CUL1Q13616 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CUL1Q13616 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CUL1Q13616 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CUL1Q13616 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CUL1Q13616 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CUL1Q13616 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CUL1Q13616 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CUL1Q13616 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CUL1Q13616 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CUL1Q13616 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CUL1Q13616 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CUL1Q13616 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CUL1Q13616 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CUL1Q13616 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CUL1Q13616 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CUL1Q13616 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CUL1Q13616 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CUL1Q13616 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CUL1Q13616 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CUL1Q13616 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CUL1Q13616 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CUL1Q13616 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CUL1Q13616 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CUL1Q13616 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CUL1Q13616 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CUL1Q13616 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CUL1Q13616 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CUL1Q13616 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CUL1Q13616 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CUL1Q13616 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CUL1Q13616 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CUL1Q13616 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CUL1Q13616 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CUL1Q13616 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CUL1Q13616 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CUL1Q13616 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CUL1Q13616 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CUL1Q13616 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CUL1Q13616 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CUL1Q13616 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CUL1Q13616 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CUL1Q13616 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CUL1Q13616 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CUL1Q13616 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CUL1Q13616 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CUL1Q13616 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CUL1Q13616 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CUL1Q13616 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CUL1Q13616 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CUL1Q13616 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CUL1Q13616 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CUL1Q13616 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CUL1Q13616 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CUL1Q13616 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CUL1Q13616 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CUL1Q13616 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CUL1Q13616 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CUL1Q13616 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CUL1Q13616 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CUL1Q13616 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CUL1Q13616 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CUL1Q13616 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CUL1Q13616 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CUL1Q13616 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CUL1Q13616 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CUL1Q13616 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CUL1Q13616 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CUL1Q13616 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CUL1Q13616 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CUL1Q13616 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CUL1Q13616 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CUL1Q13616 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
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