Protein–RNA interactions for Protein: Q13615

MTMR3, Myotubularin-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR3Q13615 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
MTMR3Q13615 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
MTMR3Q13615 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
MTMR3Q13615 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
MTMR3Q13615 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
MTMR3Q13615 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
MTMR3Q13615 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
MTMR3Q13615 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
MTMR3Q13615 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
MTMR3Q13615 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
MTMR3Q13615 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
MTMR3Q13615 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
MTMR3Q13615 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
MTMR3Q13615 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
MTMR3Q13615 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
MTMR3Q13615 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
MTMR3Q13615 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
MTMR3Q13615 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
MTMR3Q13615 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
MTMR3Q13615 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
MTMR3Q13615 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
MTMR3Q13615 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
MTMR3Q13615 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
MTMR3Q13615 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
MTMR3Q13615 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
MTMR3Q13615 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
MTMR3Q13615 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
MTMR3Q13615 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
MTMR3Q13615 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
MTMR3Q13615 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
MTMR3Q13615 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
MTMR3Q13615 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
MTMR3Q13615 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
MTMR3Q13615 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
MTMR3Q13615 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
MTMR3Q13615 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
MTMR3Q13615 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
MTMR3Q13615 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
MTMR3Q13615 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
MTMR3Q13615 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
MTMR3Q13615 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
MTMR3Q13615 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
MTMR3Q13615 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
MTMR3Q13615 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
MTMR3Q13615 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
MTMR3Q13615 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
MTMR3Q13615 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
MTMR3Q13615 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
MTMR3Q13615 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
MTMR3Q13615 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
MTMR3Q13615 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
MTMR3Q13615 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
MTMR3Q13615 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
MTMR3Q13615 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
MTMR3Q13615 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
MTMR3Q13615 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
MTMR3Q13615 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
MTMR3Q13615 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
MTMR3Q13615 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
MTMR3Q13615 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
MTMR3Q13615 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
MTMR3Q13615 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
MTMR3Q13615 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC18.85■□□□□ 0.61
MTMR3Q13615 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
MTMR3Q13615 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
MTMR3Q13615 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
MTMR3Q13615 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
MTMR3Q13615 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
MTMR3Q13615 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
MTMR3Q13615 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
MTMR3Q13615 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
MTMR3Q13615 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
MTMR3Q13615 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
MTMR3Q13615 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
MTMR3Q13615 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
MTMR3Q13615 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
MTMR3Q13615 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
MTMR3Q13615 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
MTMR3Q13615 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
MTMR3Q13615 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
MTMR3Q13615 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
MTMR3Q13615 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
MTMR3Q13615 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
MTMR3Q13615 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
MTMR3Q13615 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
MTMR3Q13615 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
MTMR3Q13615 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
MTMR3Q13615 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
MTMR3Q13615 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
MTMR3Q13615 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
MTMR3Q13615 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
MTMR3Q13615 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
MTMR3Q13615 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
MTMR3Q13615 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
MTMR3Q13615 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
MTMR3Q13615 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
MTMR3Q13615 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
MTMR3Q13615 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
MTMR3Q13615 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC18.84■□□□□ 0.61
MTMR3Q13615 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms