Protein–RNA interactions for Protein: Q13608

PEX6, Peroxisome assembly factor 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX6Q13608 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PEX6Q13608 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PEX6Q13608 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PEX6Q13608 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PEX6Q13608 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PEX6Q13608 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PEX6Q13608 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PEX6Q13608 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PEX6Q13608 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
PEX6Q13608 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PEX6Q13608 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PEX6Q13608 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PEX6Q13608 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PEX6Q13608 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PEX6Q13608 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PEX6Q13608 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PEX6Q13608 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PEX6Q13608 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PEX6Q13608 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PEX6Q13608 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PEX6Q13608 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
PEX6Q13608 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PEX6Q13608 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PEX6Q13608 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
PEX6Q13608 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PEX6Q13608 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PEX6Q13608 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PEX6Q13608 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PEX6Q13608 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PEX6Q13608 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PEX6Q13608 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PEX6Q13608 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PEX6Q13608 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PEX6Q13608 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PEX6Q13608 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PEX6Q13608 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PEX6Q13608 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PEX6Q13608 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PEX6Q13608 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PEX6Q13608 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PEX6Q13608 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PEX6Q13608 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PEX6Q13608 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PEX6Q13608 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PEX6Q13608 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PEX6Q13608 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PEX6Q13608 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PEX6Q13608 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PEX6Q13608 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PEX6Q13608 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PEX6Q13608 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PEX6Q13608 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PEX6Q13608 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PEX6Q13608 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PEX6Q13608 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PEX6Q13608 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PEX6Q13608 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PEX6Q13608 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PEX6Q13608 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PEX6Q13608 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PEX6Q13608 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
PEX6Q13608 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PEX6Q13608 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PEX6Q13608 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PEX6Q13608 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PEX6Q13608 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PEX6Q13608 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PEX6Q13608 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PEX6Q13608 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PEX6Q13608 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PEX6Q13608 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PEX6Q13608 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PEX6Q13608 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PEX6Q13608 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PEX6Q13608 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PEX6Q13608 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PEX6Q13608 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PEX6Q13608 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PEX6Q13608 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PEX6Q13608 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PEX6Q13608 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
PEX6Q13608 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PEX6Q13608 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PEX6Q13608 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PEX6Q13608 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PEX6Q13608 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PEX6Q13608 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PEX6Q13608 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PEX6Q13608 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PEX6Q13608 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PEX6Q13608 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PEX6Q13608 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PEX6Q13608 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PEX6Q13608 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PEX6Q13608 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PEX6Q13608 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PEX6Q13608 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PEX6Q13608 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PEX6Q13608 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PEX6Q13608 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
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