Protein–RNA interactions for Protein: Q13535

ATR, Serine/threonine-protein kinase ATR, humanhuman

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Length 2,644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRQ13535 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
ATRQ13535 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ATRQ13535 RHOQP1-201ENST00000555758 579 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
ATRQ13535 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
ATRQ13535 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ATRQ13535 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
ATRQ13535 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
ATRQ13535 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
ATRQ13535 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.26
ATRQ13535 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
ATRQ13535 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
ATRQ13535 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
ATRQ13535 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ATRQ13535 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ATRQ13535 AC092506.1-202ENST00000401022 528 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
ATRQ13535 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
ATRQ13535 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ATRQ13535 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ATRQ13535 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ATRQ13535 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ATRQ13535 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ATRQ13535 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
ATRQ13535 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ATRQ13535 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
ATRQ13535 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ATRQ13535 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ATRQ13535 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ATRQ13535 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ATRQ13535 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ATRQ13535 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ATRQ13535 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ATRQ13535 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ATRQ13535 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
ATRQ13535 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ATRQ13535 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ATRQ13535 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ATRQ13535 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ATRQ13535 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ATRQ13535 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ATRQ13535 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ATRQ13535 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ATRQ13535 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ATRQ13535 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ATRQ13535 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
ATRQ13535 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
ATRQ13535 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
ATRQ13535 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
ATRQ13535 MIR6727-201ENST00000620702 65 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
ATRQ13535 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ATRQ13535 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ATRQ13535 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ATRQ13535 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ATRQ13535 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ATRQ13535 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ATRQ13535 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ATRQ13535 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ATRQ13535 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ATRQ13535 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ATRQ13535 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
ATRQ13535 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ATRQ13535 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
ATRQ13535 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ATRQ13535 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ATRQ13535 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ATRQ13535 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ATRQ13535 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ATRQ13535 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ATRQ13535 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ATRQ13535 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ATRQ13535 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ATRQ13535 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ATRQ13535 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ATRQ13535 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ATRQ13535 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ATRQ13535 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ATRQ13535 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ATRQ13535 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ATRQ13535 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ATRQ13535 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
ATRQ13535 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ATRQ13535 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ATRQ13535 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ATRQ13535 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ATRQ13535 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ATRQ13535 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ATRQ13535 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
ATRQ13535 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ATRQ13535 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ATRQ13535 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ATRQ13535 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ATRQ13535 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
ATRQ13535 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
ATRQ13535 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ATRQ13535 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ATRQ13535 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ATRQ13535 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ATRQ13535 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ATRQ13535 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ATRQ13535 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ATRQ13535 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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