Protein–RNA interactions for Protein: Q13515

BFSP2, Phakinin, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BFSP2Q13515 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
BFSP2Q13515 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
BFSP2Q13515 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
BFSP2Q13515 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
BFSP2Q13515 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
BFSP2Q13515 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
BFSP2Q13515 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
BFSP2Q13515 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
BFSP2Q13515 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
BFSP2Q13515 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
BFSP2Q13515 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
BFSP2Q13515 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
BFSP2Q13515 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
BFSP2Q13515 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
BFSP2Q13515 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
BFSP2Q13515 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
BFSP2Q13515 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
BFSP2Q13515 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
BFSP2Q13515 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
BFSP2Q13515 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
BFSP2Q13515 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
BFSP2Q13515 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
BFSP2Q13515 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
BFSP2Q13515 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
BFSP2Q13515 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
BFSP2Q13515 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
BFSP2Q13515 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
BFSP2Q13515 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
BFSP2Q13515 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
BFSP2Q13515 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
BFSP2Q13515 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
BFSP2Q13515 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
BFSP2Q13515 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
BFSP2Q13515 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
BFSP2Q13515 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
BFSP2Q13515 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
BFSP2Q13515 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
BFSP2Q13515 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
BFSP2Q13515 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
BFSP2Q13515 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
BFSP2Q13515 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
BFSP2Q13515 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
BFSP2Q13515 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
BFSP2Q13515 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
BFSP2Q13515 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
BFSP2Q13515 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
BFSP2Q13515 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
BFSP2Q13515 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
BFSP2Q13515 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
BFSP2Q13515 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
BFSP2Q13515 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
BFSP2Q13515 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
BFSP2Q13515 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
BFSP2Q13515 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
BFSP2Q13515 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
BFSP2Q13515 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
BFSP2Q13515 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
BFSP2Q13515 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
BFSP2Q13515 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
BFSP2Q13515 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
BFSP2Q13515 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
BFSP2Q13515 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
BFSP2Q13515 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
BFSP2Q13515 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
BFSP2Q13515 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
BFSP2Q13515 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
BFSP2Q13515 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
BFSP2Q13515 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
BFSP2Q13515 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
BFSP2Q13515 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
BFSP2Q13515 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
BFSP2Q13515 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
BFSP2Q13515 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
BFSP2Q13515 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
BFSP2Q13515 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
BFSP2Q13515 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
BFSP2Q13515 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
BFSP2Q13515 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
BFSP2Q13515 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
BFSP2Q13515 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC18.78■□□□□ 0.6
BFSP2Q13515 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
BFSP2Q13515 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
BFSP2Q13515 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
BFSP2Q13515 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
BFSP2Q13515 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
BFSP2Q13515 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
BFSP2Q13515 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
BFSP2Q13515 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
BFSP2Q13515 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
BFSP2Q13515 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
BFSP2Q13515 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
BFSP2Q13515 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
BFSP2Q13515 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
BFSP2Q13515 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
BFSP2Q13515 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
BFSP2Q13515 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
BFSP2Q13515 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
BFSP2Q13515 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
BFSP2Q13515 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
BFSP2Q13515 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
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