Protein–RNA interactions for Protein: Q13439

GOLGA4, Golgin subfamily A member 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,230 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA4Q13439 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GOLGA4Q13439 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GOLGA4Q13439 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GOLGA4Q13439 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
GOLGA4Q13439 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
GOLGA4Q13439 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GOLGA4Q13439 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GOLGA4Q13439 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GOLGA4Q13439 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GOLGA4Q13439 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GOLGA4Q13439 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GOLGA4Q13439 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GOLGA4Q13439 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GOLGA4Q13439 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GOLGA4Q13439 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
GOLGA4Q13439 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GOLGA4Q13439 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GOLGA4Q13439 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GOLGA4Q13439 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GOLGA4Q13439 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GOLGA4Q13439 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GOLGA4Q13439 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GOLGA4Q13439 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GOLGA4Q13439 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GOLGA4Q13439 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GOLGA4Q13439 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GOLGA4Q13439 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GOLGA4Q13439 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GOLGA4Q13439 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GOLGA4Q13439 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GOLGA4Q13439 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GOLGA4Q13439 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GOLGA4Q13439 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GOLGA4Q13439 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GOLGA4Q13439 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GOLGA4Q13439 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GOLGA4Q13439 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GOLGA4Q13439 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GOLGA4Q13439 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GOLGA4Q13439 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
GOLGA4Q13439 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GOLGA4Q13439 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GOLGA4Q13439 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GOLGA4Q13439 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GOLGA4Q13439 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
GOLGA4Q13439 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GOLGA4Q13439 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GOLGA4Q13439 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GOLGA4Q13439 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GOLGA4Q13439 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GOLGA4Q13439 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GOLGA4Q13439 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GOLGA4Q13439 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GOLGA4Q13439 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GOLGA4Q13439 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GOLGA4Q13439 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GOLGA4Q13439 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GOLGA4Q13439 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GOLGA4Q13439 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GOLGA4Q13439 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GOLGA4Q13439 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GOLGA4Q13439 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GOLGA4Q13439 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GOLGA4Q13439 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GOLGA4Q13439 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GOLGA4Q13439 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GOLGA4Q13439 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GOLGA4Q13439 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GOLGA4Q13439 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GOLGA4Q13439 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GOLGA4Q13439 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GOLGA4Q13439 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GOLGA4Q13439 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GOLGA4Q13439 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GOLGA4Q13439 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GOLGA4Q13439 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GOLGA4Q13439 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GOLGA4Q13439 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GOLGA4Q13439 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GOLGA4Q13439 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GOLGA4Q13439 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GOLGA4Q13439 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GOLGA4Q13439 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GOLGA4Q13439 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GOLGA4Q13439 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GOLGA4Q13439 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GOLGA4Q13439 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GOLGA4Q13439 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
GOLGA4Q13439 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GOLGA4Q13439 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GOLGA4Q13439 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GOLGA4Q13439 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GOLGA4Q13439 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GOLGA4Q13439 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GOLGA4Q13439 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GOLGA4Q13439 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GOLGA4Q13439 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GOLGA4Q13439 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GOLGA4Q13439 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
GOLGA4Q13439 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
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