Protein–RNA interactions for Protein: Q13342

SP140, Nuclear body protein SP140, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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SP140Q13342 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SP140Q13342 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SP140Q13342 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SP140Q13342 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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SP140Q13342 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SP140Q13342 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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SP140Q13342 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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SP140Q13342 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SP140Q13342 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SP140Q13342 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SP140Q13342 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
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SP140Q13342 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
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SP140Q13342 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
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SP140Q13342 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
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