Protein–RNA interactions for Protein: Q13332

PTPRS, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase S, humanhuman

Predictions only

Length 1,948 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRSQ13332 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPRSQ13332 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPRSQ13332 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPRSQ13332 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPRSQ13332 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPRSQ13332 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPRSQ13332 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPRSQ13332 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPRSQ13332 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPRSQ13332 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPRSQ13332 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPRSQ13332 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPRSQ13332 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPRSQ13332 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPRSQ13332 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPRSQ13332 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPRSQ13332 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPRSQ13332 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPRSQ13332 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPRSQ13332 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPRSQ13332 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPRSQ13332 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPRSQ13332 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPRSQ13332 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPRSQ13332 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPRSQ13332 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPRSQ13332 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPRSQ13332 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPRSQ13332 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPRSQ13332 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPRSQ13332 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPRSQ13332 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPRSQ13332 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPRSQ13332 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPRSQ13332 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPRSQ13332 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPRSQ13332 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPRSQ13332 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPRSQ13332 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPRSQ13332 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPRSQ13332 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
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PTPRSQ13332 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
PTPRSQ13332 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
PTPRSQ13332 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
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PTPRSQ13332 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPRSQ13332 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPRSQ13332 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPRSQ13332 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPRSQ13332 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPRSQ13332 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPRSQ13332 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPRSQ13332 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
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PTPRSQ13332 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
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PTPRSQ13332 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPRSQ13332 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPRSQ13332 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPRSQ13332 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPRSQ13332 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPRSQ13332 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPRSQ13332 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
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PTPRSQ13332 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPRSQ13332 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
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PTPRSQ13332 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPRSQ13332 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
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PTPRSQ13332 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPRSQ13332 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPRSQ13332 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPRSQ13332 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPRSQ13332 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPRSQ13332 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPRSQ13332 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
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