Protein–RNA interactions for Protein: Q13243

SRSF5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF5Q13243 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SRSF5Q13243 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SRSF5Q13243 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
SRSF5Q13243 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SRSF5Q13243 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SRSF5Q13243 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SRSF5Q13243 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SRSF5Q13243 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SRSF5Q13243 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SRSF5Q13243 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SRSF5Q13243 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SRSF5Q13243 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SRSF5Q13243 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SRSF5Q13243 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SRSF5Q13243 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SRSF5Q13243 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SRSF5Q13243 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SRSF5Q13243 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SRSF5Q13243 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SRSF5Q13243 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SRSF5Q13243 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SRSF5Q13243 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SRSF5Q13243 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
SRSF5Q13243 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SRSF5Q13243 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SRSF5Q13243 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SRSF5Q13243 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
SRSF5Q13243 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SRSF5Q13243 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SRSF5Q13243 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SRSF5Q13243 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SRSF5Q13243 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SRSF5Q13243 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SRSF5Q13243 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SRSF5Q13243 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SRSF5Q13243 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SRSF5Q13243 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SRSF5Q13243 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SRSF5Q13243 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SRSF5Q13243 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SRSF5Q13243 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SRSF5Q13243 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SRSF5Q13243 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SRSF5Q13243 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SRSF5Q13243 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SRSF5Q13243 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SRSF5Q13243 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SRSF5Q13243 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SRSF5Q13243 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SRSF5Q13243 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SRSF5Q13243 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
SRSF5Q13243 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SRSF5Q13243 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SRSF5Q13243 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SRSF5Q13243 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
SRSF5Q13243 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SRSF5Q13243 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SRSF5Q13243 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SRSF5Q13243 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
SRSF5Q13243 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
SRSF5Q13243 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SRSF5Q13243 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
SRSF5Q13243 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SRSF5Q13243 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SRSF5Q13243 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SRSF5Q13243 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SRSF5Q13243 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SRSF5Q13243 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SRSF5Q13243 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SRSF5Q13243 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
SRSF5Q13243 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SRSF5Q13243 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SRSF5Q13243 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SRSF5Q13243 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SRSF5Q13243 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SRSF5Q13243 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SRSF5Q13243 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SRSF5Q13243 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SRSF5Q13243 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SRSF5Q13243 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SRSF5Q13243 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SRSF5Q13243 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SRSF5Q13243 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SRSF5Q13243 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SRSF5Q13243 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SRSF5Q13243 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SRSF5Q13243 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SRSF5Q13243 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SRSF5Q13243 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SRSF5Q13243 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SRSF5Q13243 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SRSF5Q13243 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SRSF5Q13243 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
SRSF5Q13243 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SRSF5Q13243 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SRSF5Q13243 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SRSF5Q13243 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SRSF5Q13243 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SRSF5Q13243 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
SRSF5Q13243 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
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