Protein–RNA interactions for Protein: Q13232

NME3, Nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

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Length 169 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3Q13232 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NME3Q13232 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NME3Q13232 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NME3Q13232 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NME3Q13232 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NME3Q13232 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NME3Q13232 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NME3Q13232 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NME3Q13232 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NME3Q13232 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NME3Q13232 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NME3Q13232 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NME3Q13232 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NME3Q13232 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NME3Q13232 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NME3Q13232 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NME3Q13232 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NME3Q13232 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NME3Q13232 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NME3Q13232 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NME3Q13232 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NME3Q13232 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NME3Q13232 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NME3Q13232 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NME3Q13232 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NME3Q13232 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
NME3Q13232 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NME3Q13232 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NME3Q13232 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NME3Q13232 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NME3Q13232 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NME3Q13232 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NME3Q13232 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NME3Q13232 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NME3Q13232 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NME3Q13232 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NME3Q13232 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NME3Q13232 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NME3Q13232 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NME3Q13232 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NME3Q13232 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NME3Q13232 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
NME3Q13232 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NME3Q13232 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NME3Q13232 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NME3Q13232 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NME3Q13232 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
NME3Q13232 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
NME3Q13232 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NME3Q13232 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NME3Q13232 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
NME3Q13232 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NME3Q13232 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NME3Q13232 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NME3Q13232 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NME3Q13232 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NME3Q13232 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NME3Q13232 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NME3Q13232 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NME3Q13232 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NME3Q13232 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NME3Q13232 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NME3Q13232 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NME3Q13232 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NME3Q13232 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NME3Q13232 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NME3Q13232 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NME3Q13232 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NME3Q13232 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NME3Q13232 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NME3Q13232 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NME3Q13232 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NME3Q13232 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NME3Q13232 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NME3Q13232 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
NME3Q13232 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NME3Q13232 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NME3Q13232 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NME3Q13232 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NME3Q13232 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NME3Q13232 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
NME3Q13232 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NME3Q13232 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NME3Q13232 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NME3Q13232 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NME3Q13232 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NME3Q13232 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NME3Q13232 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NME3Q13232 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NME3Q13232 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NME3Q13232 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NME3Q13232 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NME3Q13232 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NME3Q13232 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NME3Q13232 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NME3Q13232 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NME3Q13232 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NME3Q13232 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NME3Q13232 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
NME3Q13232 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
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