Protein–RNA interactions for Protein: Q13206

DDX10, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX10, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX10Q13206 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
DDX10Q13206 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
DDX10Q13206 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
DDX10Q13206 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
DDX10Q13206 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
DDX10Q13206 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
DDX10Q13206 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
DDX10Q13206 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
DDX10Q13206 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
DDX10Q13206 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
DDX10Q13206 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
DDX10Q13206 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
DDX10Q13206 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
DDX10Q13206 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
DDX10Q13206 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
DDX10Q13206 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
DDX10Q13206 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
DDX10Q13206 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
DDX10Q13206 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
DDX10Q13206 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
DDX10Q13206 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
DDX10Q13206 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
DDX10Q13206 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
DDX10Q13206 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
DDX10Q13206 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
DDX10Q13206 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
DDX10Q13206 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
DDX10Q13206 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
DDX10Q13206 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
DDX10Q13206 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
DDX10Q13206 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
DDX10Q13206 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
DDX10Q13206 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
DDX10Q13206 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
DDX10Q13206 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
DDX10Q13206 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
DDX10Q13206 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
DDX10Q13206 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
DDX10Q13206 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
DDX10Q13206 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
DDX10Q13206 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
DDX10Q13206 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
DDX10Q13206 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
DDX10Q13206 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
DDX10Q13206 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
DDX10Q13206 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
DDX10Q13206 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
DDX10Q13206 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
DDX10Q13206 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
DDX10Q13206 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
DDX10Q13206 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
DDX10Q13206 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
DDX10Q13206 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
DDX10Q13206 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
DDX10Q13206 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
DDX10Q13206 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
DDX10Q13206 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
DDX10Q13206 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
DDX10Q13206 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
DDX10Q13206 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
DDX10Q13206 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
DDX10Q13206 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
DDX10Q13206 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
DDX10Q13206 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
DDX10Q13206 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
DDX10Q13206 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
DDX10Q13206 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
DDX10Q13206 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
DDX10Q13206 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
DDX10Q13206 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
DDX10Q13206 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
DDX10Q13206 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
DDX10Q13206 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
DDX10Q13206 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
DDX10Q13206 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
DDX10Q13206 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
DDX10Q13206 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
DDX10Q13206 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
DDX10Q13206 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
DDX10Q13206 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
DDX10Q13206 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DDX10Q13206 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DDX10Q13206 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DDX10Q13206 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DDX10Q13206 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DDX10Q13206 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DDX10Q13206 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
DDX10Q13206 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
DDX10Q13206 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DDX10Q13206 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
DDX10Q13206 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DDX10Q13206 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
DDX10Q13206 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
DDX10Q13206 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
DDX10Q13206 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
DDX10Q13206 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DDX10Q13206 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DDX10Q13206 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
DDX10Q13206 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DDX10Q13206 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.6 ms