Protein–RNA interactions for Protein: Q13094

LCP2, Lymphocyte cytosolic protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCP2Q13094 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
LCP2Q13094 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
LCP2Q13094 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
LCP2Q13094 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
LCP2Q13094 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
LCP2Q13094 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
LCP2Q13094 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
LCP2Q13094 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
LCP2Q13094 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
LCP2Q13094 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
LCP2Q13094 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
LCP2Q13094 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
LCP2Q13094 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
LCP2Q13094 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
LCP2Q13094 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
LCP2Q13094 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LCP2Q13094 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LCP2Q13094 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LCP2Q13094 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LCP2Q13094 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
LCP2Q13094 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
LCP2Q13094 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
LCP2Q13094 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
LCP2Q13094 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LCP2Q13094 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
LCP2Q13094 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LCP2Q13094 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LCP2Q13094 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LCP2Q13094 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LCP2Q13094 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
LCP2Q13094 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LCP2Q13094 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
LCP2Q13094 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
LCP2Q13094 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
LCP2Q13094 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LCP2Q13094 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
LCP2Q13094 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
LCP2Q13094 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LCP2Q13094 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LCP2Q13094 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LCP2Q13094 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC16.82■□□□□ 0.28
LCP2Q13094 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
LCP2Q13094 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
LCP2Q13094 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
LCP2Q13094 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
LCP2Q13094 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
LCP2Q13094 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
LCP2Q13094 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LCP2Q13094 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LCP2Q13094 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
LCP2Q13094 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LCP2Q13094 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
LCP2Q13094 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
LCP2Q13094 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
LCP2Q13094 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
LCP2Q13094 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
LCP2Q13094 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LCP2Q13094 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LCP2Q13094 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LCP2Q13094 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
LCP2Q13094 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LCP2Q13094 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LCP2Q13094 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
LCP2Q13094 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LCP2Q13094 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LCP2Q13094 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LCP2Q13094 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
LCP2Q13094 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
LCP2Q13094 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LCP2Q13094 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LCP2Q13094 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LCP2Q13094 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
LCP2Q13094 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
LCP2Q13094 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
LCP2Q13094 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
LCP2Q13094 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
LCP2Q13094 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
LCP2Q13094 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LCP2Q13094 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
LCP2Q13094 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LCP2Q13094 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LCP2Q13094 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LCP2Q13094 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LCP2Q13094 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LCP2Q13094 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
LCP2Q13094 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
LCP2Q13094 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
LCP2Q13094 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
LCP2Q13094 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
LCP2Q13094 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
LCP2Q13094 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
LCP2Q13094 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
LCP2Q13094 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
LCP2Q13094 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
LCP2Q13094 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
LCP2Q13094 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
LCP2Q13094 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
LCP2Q13094 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
LCP2Q13094 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
LCP2Q13094 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms