Protein–RNA interactions for Protein: Q12986

NFX1, Transcriptional repressor NF-X1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,120 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFX1Q12986 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NFX1Q12986 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NFX1Q12986 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NFX1Q12986 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NFX1Q12986 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NFX1Q12986 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NFX1Q12986 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NFX1Q12986 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NFX1Q12986 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NFX1Q12986 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
NFX1Q12986 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NFX1Q12986 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NFX1Q12986 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NFX1Q12986 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NFX1Q12986 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NFX1Q12986 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NFX1Q12986 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NFX1Q12986 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NFX1Q12986 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NFX1Q12986 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NFX1Q12986 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NFX1Q12986 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NFX1Q12986 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NFX1Q12986 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NFX1Q12986 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NFX1Q12986 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
NFX1Q12986 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
NFX1Q12986 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
NFX1Q12986 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
NFX1Q12986 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
NFX1Q12986 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NFX1Q12986 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NFX1Q12986 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC19■□□□□ 0.63
NFX1Q12986 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NFX1Q12986 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
NFX1Q12986 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NFX1Q12986 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
NFX1Q12986 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
NFX1Q12986 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
NFX1Q12986 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC19■□□□□ 0.63
NFX1Q12986 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC19■□□□□ 0.63
NFX1Q12986 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NFX1Q12986 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NFX1Q12986 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NFX1Q12986 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
NFX1Q12986 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NFX1Q12986 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NFX1Q12986 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NFX1Q12986 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NFX1Q12986 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
NFX1Q12986 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NFX1Q12986 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NFX1Q12986 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NFX1Q12986 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
NFX1Q12986 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NFX1Q12986 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
NFX1Q12986 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
NFX1Q12986 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
NFX1Q12986 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NFX1Q12986 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
NFX1Q12986 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NFX1Q12986 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NFX1Q12986 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NFX1Q12986 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NFX1Q12986 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NFX1Q12986 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NFX1Q12986 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NFX1Q12986 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NFX1Q12986 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NFX1Q12986 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NFX1Q12986 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NFX1Q12986 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NFX1Q12986 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NFX1Q12986 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NFX1Q12986 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NFX1Q12986 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NFX1Q12986 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NFX1Q12986 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NFX1Q12986 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NFX1Q12986 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NFX1Q12986 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NFX1Q12986 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NFX1Q12986 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NFX1Q12986 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NFX1Q12986 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NFX1Q12986 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NFX1Q12986 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
NFX1Q12986 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NFX1Q12986 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NFX1Q12986 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NFX1Q12986 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NFX1Q12986 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NFX1Q12986 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NFX1Q12986 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NFX1Q12986 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NFX1Q12986 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
NFX1Q12986 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NFX1Q12986 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NFX1Q12986 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NFX1Q12986 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
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