Protein–RNA interactions for Protein: Q12980

NPRL3, GATOR complex protein NPRL3, humanhuman

Predictions only

Length 569 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPRL3Q12980 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NPRL3Q12980 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NPRL3Q12980 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NPRL3Q12980 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
NPRL3Q12980 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NPRL3Q12980 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NPRL3Q12980 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NPRL3Q12980 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NPRL3Q12980 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NPRL3Q12980 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NPRL3Q12980 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NPRL3Q12980 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NPRL3Q12980 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NPRL3Q12980 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NPRL3Q12980 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NPRL3Q12980 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NPRL3Q12980 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NPRL3Q12980 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NPRL3Q12980 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NPRL3Q12980 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NPRL3Q12980 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NPRL3Q12980 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NPRL3Q12980 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
NPRL3Q12980 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NPRL3Q12980 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NPRL3Q12980 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NPRL3Q12980 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NPRL3Q12980 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
NPRL3Q12980 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NPRL3Q12980 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NPRL3Q12980 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NPRL3Q12980 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NPRL3Q12980 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NPRL3Q12980 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
NPRL3Q12980 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NPRL3Q12980 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NPRL3Q12980 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NPRL3Q12980 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NPRL3Q12980 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NPRL3Q12980 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NPRL3Q12980 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NPRL3Q12980 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NPRL3Q12980 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NPRL3Q12980 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NPRL3Q12980 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NPRL3Q12980 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NPRL3Q12980 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NPRL3Q12980 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NPRL3Q12980 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NPRL3Q12980 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NPRL3Q12980 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NPRL3Q12980 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NPRL3Q12980 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NPRL3Q12980 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NPRL3Q12980 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NPRL3Q12980 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NPRL3Q12980 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NPRL3Q12980 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NPRL3Q12980 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NPRL3Q12980 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NPRL3Q12980 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NPRL3Q12980 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NPRL3Q12980 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NPRL3Q12980 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NPRL3Q12980 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NPRL3Q12980 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NPRL3Q12980 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NPRL3Q12980 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NPRL3Q12980 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NPRL3Q12980 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NPRL3Q12980 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NPRL3Q12980 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NPRL3Q12980 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
NPRL3Q12980 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NPRL3Q12980 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NPRL3Q12980 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NPRL3Q12980 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NPRL3Q12980 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NPRL3Q12980 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
NPRL3Q12980 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NPRL3Q12980 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NPRL3Q12980 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NPRL3Q12980 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NPRL3Q12980 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NPRL3Q12980 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NPRL3Q12980 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NPRL3Q12980 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NPRL3Q12980 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NPRL3Q12980 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NPRL3Q12980 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NPRL3Q12980 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NPRL3Q12980 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NPRL3Q12980 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NPRL3Q12980 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NPRL3Q12980 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NPRL3Q12980 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NPRL3Q12980 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NPRL3Q12980 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NPRL3Q12980 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NPRL3Q12980 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69 ms