Protein–RNA interactions for Protein: Q12907

LMAN2, Vesicular integral-membrane protein VIP36, humanhuman

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Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMAN2Q12907 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LMAN2Q12907 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LMAN2Q12907 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LMAN2Q12907 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LMAN2Q12907 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LMAN2Q12907 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LMAN2Q12907 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LMAN2Q12907 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LMAN2Q12907 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LMAN2Q12907 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LMAN2Q12907 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
LMAN2Q12907 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
LMAN2Q12907 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
LMAN2Q12907 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
LMAN2Q12907 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
LMAN2Q12907 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
LMAN2Q12907 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
LMAN2Q12907 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
LMAN2Q12907 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
LMAN2Q12907 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
LMAN2Q12907 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
LMAN2Q12907 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
LMAN2Q12907 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
LMAN2Q12907 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
LMAN2Q12907 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
LMAN2Q12907 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
LMAN2Q12907 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
LMAN2Q12907 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
LMAN2Q12907 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
LMAN2Q12907 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
LMAN2Q12907 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
LMAN2Q12907 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
LMAN2Q12907 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
LMAN2Q12907 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
LMAN2Q12907 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
LMAN2Q12907 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
LMAN2Q12907 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
LMAN2Q12907 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
LMAN2Q12907 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LMAN2Q12907 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LMAN2Q12907 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LMAN2Q12907 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LMAN2Q12907 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LMAN2Q12907 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LMAN2Q12907 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LMAN2Q12907 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LMAN2Q12907 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LMAN2Q12907 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LMAN2Q12907 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LMAN2Q12907 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LMAN2Q12907 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LMAN2Q12907 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LMAN2Q12907 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
LMAN2Q12907 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LMAN2Q12907 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LMAN2Q12907 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LMAN2Q12907 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LMAN2Q12907 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
LMAN2Q12907 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LMAN2Q12907 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
LMAN2Q12907 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LMAN2Q12907 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LMAN2Q12907 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LMAN2Q12907 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LMAN2Q12907 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LMAN2Q12907 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LMAN2Q12907 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LMAN2Q12907 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LMAN2Q12907 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LMAN2Q12907 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LMAN2Q12907 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LMAN2Q12907 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LMAN2Q12907 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LMAN2Q12907 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LMAN2Q12907 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LMAN2Q12907 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
LMAN2Q12907 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
LMAN2Q12907 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LMAN2Q12907 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LMAN2Q12907 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
LMAN2Q12907 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LMAN2Q12907 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
LMAN2Q12907 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
LMAN2Q12907 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LMAN2Q12907 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
LMAN2Q12907 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LMAN2Q12907 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LMAN2Q12907 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LMAN2Q12907 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
LMAN2Q12907 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
LMAN2Q12907 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
LMAN2Q12907 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LMAN2Q12907 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
LMAN2Q12907 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LMAN2Q12907 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LMAN2Q12907 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LMAN2Q12907 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LMAN2Q12907 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
LMAN2Q12907 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LMAN2Q12907 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
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