Protein–RNA interactions for Protein: Q12830

BPTF, Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF, humanhuman

Predictions only

Length 3,046 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPTFQ12830 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
BPTFQ12830 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
BPTFQ12830 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
BPTFQ12830 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
BPTFQ12830 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
BPTFQ12830 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BPTFQ12830 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
BPTFQ12830 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BPTFQ12830 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BPTFQ12830 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
BPTFQ12830 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
BPTFQ12830 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
BPTFQ12830 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
BPTFQ12830 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
BPTFQ12830 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
BPTFQ12830 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
BPTFQ12830 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BPTFQ12830 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
BPTFQ12830 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
BPTFQ12830 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
BPTFQ12830 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
BPTFQ12830 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
BPTFQ12830 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BPTFQ12830 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
BPTFQ12830 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BPTFQ12830 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BPTFQ12830 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
BPTFQ12830 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
BPTFQ12830 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BPTFQ12830 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
BPTFQ12830 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
BPTFQ12830 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BPTFQ12830 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BPTFQ12830 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
BPTFQ12830 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BPTFQ12830 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
BPTFQ12830 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
BPTFQ12830 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BPTFQ12830 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BPTFQ12830 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BPTFQ12830 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BPTFQ12830 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
BPTFQ12830 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
BPTFQ12830 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
BPTFQ12830 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
BPTFQ12830 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
BPTFQ12830 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
BPTFQ12830 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
BPTFQ12830 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
BPTFQ12830 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
BPTFQ12830 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
BPTFQ12830 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
BPTFQ12830 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
BPTFQ12830 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
BPTFQ12830 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
BPTFQ12830 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
BPTFQ12830 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
BPTFQ12830 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
BPTFQ12830 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
BPTFQ12830 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
BPTFQ12830 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
BPTFQ12830 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
BPTFQ12830 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
BPTFQ12830 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
BPTFQ12830 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
BPTFQ12830 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
BPTFQ12830 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
BPTFQ12830 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
BPTFQ12830 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
BPTFQ12830 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
BPTFQ12830 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
BPTFQ12830 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
BPTFQ12830 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
BPTFQ12830 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
BPTFQ12830 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
BPTFQ12830 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
BPTFQ12830 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
BPTFQ12830 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
BPTFQ12830 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
BPTFQ12830 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
BPTFQ12830 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
BPTFQ12830 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
BPTFQ12830 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
BPTFQ12830 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
BPTFQ12830 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
BPTFQ12830 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
BPTFQ12830 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
BPTFQ12830 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
BPTFQ12830 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
BPTFQ12830 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
BPTFQ12830 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
BPTFQ12830 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
BPTFQ12830 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
BPTFQ12830 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
BPTFQ12830 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
BPTFQ12830 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
BPTFQ12830 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
BPTFQ12830 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
BPTFQ12830 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
BPTFQ12830 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.6 ms