Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2K3

RIPPLY1, Protein ripply1, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPPLY1Q0D2K3 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RIPPLY1Q0D2K3 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RIPPLY1Q0D2K3 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RIPPLY1Q0D2K3 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RIPPLY1Q0D2K3 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
RIPPLY1Q0D2K3 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RIPPLY1Q0D2K3 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RIPPLY1Q0D2K3 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RIPPLY1Q0D2K3 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RIPPLY1Q0D2K3 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RIPPLY1Q0D2K3 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RIPPLY1Q0D2K3 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RIPPLY1Q0D2K3 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RIPPLY1Q0D2K3 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RIPPLY1Q0D2K3 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RIPPLY1Q0D2K3 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RIPPLY1Q0D2K3 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RIPPLY1Q0D2K3 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RIPPLY1Q0D2K3 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RIPPLY1Q0D2K3 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RIPPLY1Q0D2K3 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
RIPPLY1Q0D2K3 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RIPPLY1Q0D2K3 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RIPPLY1Q0D2K3 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RIPPLY1Q0D2K3 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RIPPLY1Q0D2K3 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RIPPLY1Q0D2K3 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RIPPLY1Q0D2K3 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RIPPLY1Q0D2K3 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RIPPLY1Q0D2K3 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RIPPLY1Q0D2K3 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RIPPLY1Q0D2K3 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RIPPLY1Q0D2K3 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RIPPLY1Q0D2K3 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RIPPLY1Q0D2K3 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RIPPLY1Q0D2K3 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RIPPLY1Q0D2K3 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RIPPLY1Q0D2K3 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RIPPLY1Q0D2K3 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RIPPLY1Q0D2K3 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RIPPLY1Q0D2K3 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RIPPLY1Q0D2K3 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RIPPLY1Q0D2K3 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RIPPLY1Q0D2K3 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RIPPLY1Q0D2K3 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RIPPLY1Q0D2K3 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RIPPLY1Q0D2K3 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RIPPLY1Q0D2K3 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RIPPLY1Q0D2K3 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RIPPLY1Q0D2K3 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RIPPLY1Q0D2K3 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RIPPLY1Q0D2K3 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RIPPLY1Q0D2K3 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RIPPLY1Q0D2K3 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RIPPLY1Q0D2K3 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RIPPLY1Q0D2K3 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RIPPLY1Q0D2K3 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RIPPLY1Q0D2K3 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RIPPLY1Q0D2K3 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RIPPLY1Q0D2K3 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RIPPLY1Q0D2K3 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RIPPLY1Q0D2K3 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RIPPLY1Q0D2K3 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RIPPLY1Q0D2K3 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RIPPLY1Q0D2K3 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RIPPLY1Q0D2K3 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
RIPPLY1Q0D2K3 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RIPPLY1Q0D2K3 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
RIPPLY1Q0D2K3 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RIPPLY1Q0D2K3 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RIPPLY1Q0D2K3 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RIPPLY1Q0D2K3 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RIPPLY1Q0D2K3 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RIPPLY1Q0D2K3 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RIPPLY1Q0D2K3 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RIPPLY1Q0D2K3 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RIPPLY1Q0D2K3 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RIPPLY1Q0D2K3 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RIPPLY1Q0D2K3 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RIPPLY1Q0D2K3 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RIPPLY1Q0D2K3 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RIPPLY1Q0D2K3 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RIPPLY1Q0D2K3 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RIPPLY1Q0D2K3 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RIPPLY1Q0D2K3 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RIPPLY1Q0D2K3 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RIPPLY1Q0D2K3 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RIPPLY1Q0D2K3 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RIPPLY1Q0D2K3 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RIPPLY1Q0D2K3 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RIPPLY1Q0D2K3 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RIPPLY1Q0D2K3 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RIPPLY1Q0D2K3 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RIPPLY1Q0D2K3 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RIPPLY1Q0D2K3 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RIPPLY1Q0D2K3 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RIPPLY1Q0D2K3 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RIPPLY1Q0D2K3 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RIPPLY1Q0D2K3 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RIPPLY1Q0D2K3 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.2 ms