Protein–RNA interactions for Protein: Q08708

CD300C, CMRF35-like molecule 6, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD300CQ08708 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CD300CQ08708 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CD300CQ08708 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CD300CQ08708 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CD300CQ08708 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
CD300CQ08708 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CD300CQ08708 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CD300CQ08708 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CD300CQ08708 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CD300CQ08708 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CD300CQ08708 FBXL16-201ENST00000324361 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CD300CQ08708 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CD300CQ08708 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CD300CQ08708 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CD300CQ08708 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CD300CQ08708 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CD300CQ08708 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CD300CQ08708 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CD300CQ08708 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CD300CQ08708 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CD300CQ08708 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CD300CQ08708 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CD300CQ08708 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CD300CQ08708 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CD300CQ08708 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CD300CQ08708 HSD17B4-222ENST00000515320 2494 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CD300CQ08708 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CD300CQ08708 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CD300CQ08708 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CD300CQ08708 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CD300CQ08708 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CD300CQ08708 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CD300CQ08708 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CD300CQ08708 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CD300CQ08708 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CD300CQ08708 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CD300CQ08708 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CD300CQ08708 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
CD300CQ08708 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CD300CQ08708 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
CD300CQ08708 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CD300CQ08708 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CD300CQ08708 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CD300CQ08708 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CD300CQ08708 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CD300CQ08708 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CD300CQ08708 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CD300CQ08708 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CD300CQ08708 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CD300CQ08708 GRIK5-201ENST00000262895 3493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CD300CQ08708 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CD300CQ08708 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
CD300CQ08708 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CD300CQ08708 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CD300CQ08708 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CD300CQ08708 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CD300CQ08708 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CD300CQ08708 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CD300CQ08708 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
CD300CQ08708 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CD300CQ08708 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CD300CQ08708 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
CD300CQ08708 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
CD300CQ08708 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
CD300CQ08708 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
CD300CQ08708 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
CD300CQ08708 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
CD300CQ08708 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
CD300CQ08708 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
CD300CQ08708 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CD300CQ08708 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CD300CQ08708 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CD300CQ08708 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CD300CQ08708 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CD300CQ08708 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CD300CQ08708 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CD300CQ08708 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CD300CQ08708 EIF5-202ENST00000392715 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CD300CQ08708 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CD300CQ08708 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CD300CQ08708 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
CD300CQ08708 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CD300CQ08708 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CD300CQ08708 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CD300CQ08708 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CD300CQ08708 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
CD300CQ08708 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
CD300CQ08708 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
CD300CQ08708 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
CD300CQ08708 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CD300CQ08708 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CD300CQ08708 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CD300CQ08708 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CD300CQ08708 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CD300CQ08708 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CD300CQ08708 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CD300CQ08708 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CD300CQ08708 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CD300CQ08708 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CD300CQ08708 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms