Protein–RNA interactions for Protein: Q08629

SPOCK1, Testican-1, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCK1Q08629 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPOCK1Q08629 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPOCK1Q08629 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPOCK1Q08629 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPOCK1Q08629 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPOCK1Q08629 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPOCK1Q08629 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPOCK1Q08629 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPOCK1Q08629 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPOCK1Q08629 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPOCK1Q08629 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPOCK1Q08629 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPOCK1Q08629 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPOCK1Q08629 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SPOCK1Q08629 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SPOCK1Q08629 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SPOCK1Q08629 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SPOCK1Q08629 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPOCK1Q08629 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SPOCK1Q08629 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPOCK1Q08629 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPOCK1Q08629 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPOCK1Q08629 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPOCK1Q08629 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPOCK1Q08629 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPOCK1Q08629 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPOCK1Q08629 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPOCK1Q08629 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPOCK1Q08629 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPOCK1Q08629 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPOCK1Q08629 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPOCK1Q08629 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPOCK1Q08629 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPOCK1Q08629 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPOCK1Q08629 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPOCK1Q08629 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SPOCK1Q08629 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPOCK1Q08629 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPOCK1Q08629 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPOCK1Q08629 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SPOCK1Q08629 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPOCK1Q08629 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPOCK1Q08629 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPOCK1Q08629 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPOCK1Q08629 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPOCK1Q08629 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPOCK1Q08629 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPOCK1Q08629 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPOCK1Q08629 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPOCK1Q08629 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SPOCK1Q08629 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SPOCK1Q08629 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPOCK1Q08629 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPOCK1Q08629 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPOCK1Q08629 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPOCK1Q08629 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPOCK1Q08629 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPOCK1Q08629 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPOCK1Q08629 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPOCK1Q08629 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPOCK1Q08629 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPOCK1Q08629 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SPOCK1Q08629 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SPOCK1Q08629 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPOCK1Q08629 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPOCK1Q08629 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPOCK1Q08629 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPOCK1Q08629 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPOCK1Q08629 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPOCK1Q08629 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPOCK1Q08629 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPOCK1Q08629 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPOCK1Q08629 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPOCK1Q08629 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPOCK1Q08629 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPOCK1Q08629 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPOCK1Q08629 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPOCK1Q08629 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPOCK1Q08629 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPOCK1Q08629 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPOCK1Q08629 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPOCK1Q08629 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPOCK1Q08629 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPOCK1Q08629 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPOCK1Q08629 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPOCK1Q08629 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPOCK1Q08629 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPOCK1Q08629 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPOCK1Q08629 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPOCK1Q08629 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPOCK1Q08629 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SPOCK1Q08629 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPOCK1Q08629 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPOCK1Q08629 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPOCK1Q08629 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPOCK1Q08629 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPOCK1Q08629 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPOCK1Q08629 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPOCK1Q08629 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPOCK1Q08629 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms