Protein–RNA interactions for Protein: Q08554

DSC1, Desmocollin-1, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC1Q08554 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DSC1Q08554 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DSC1Q08554 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DSC1Q08554 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DSC1Q08554 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DSC1Q08554 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DSC1Q08554 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DSC1Q08554 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
DSC1Q08554 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DSC1Q08554 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DSC1Q08554 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DSC1Q08554 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DSC1Q08554 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DSC1Q08554 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DSC1Q08554 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DSC1Q08554 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DSC1Q08554 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DSC1Q08554 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DSC1Q08554 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DSC1Q08554 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DSC1Q08554 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DSC1Q08554 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DSC1Q08554 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DSC1Q08554 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DSC1Q08554 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
DSC1Q08554 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DSC1Q08554 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DSC1Q08554 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DSC1Q08554 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DSC1Q08554 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DSC1Q08554 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DSC1Q08554 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DSC1Q08554 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DSC1Q08554 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DSC1Q08554 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DSC1Q08554 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DSC1Q08554 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DSC1Q08554 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DSC1Q08554 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DSC1Q08554 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DSC1Q08554 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DSC1Q08554 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DSC1Q08554 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DSC1Q08554 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
DSC1Q08554 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DSC1Q08554 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DSC1Q08554 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DSC1Q08554 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DSC1Q08554 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
DSC1Q08554 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DSC1Q08554 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DSC1Q08554 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DSC1Q08554 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DSC1Q08554 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DSC1Q08554 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
DSC1Q08554 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DSC1Q08554 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DSC1Q08554 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DSC1Q08554 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DSC1Q08554 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DSC1Q08554 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DSC1Q08554 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DSC1Q08554 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DSC1Q08554 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DSC1Q08554 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DSC1Q08554 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DSC1Q08554 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DSC1Q08554 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DSC1Q08554 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DSC1Q08554 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DSC1Q08554 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DSC1Q08554 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DSC1Q08554 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DSC1Q08554 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DSC1Q08554 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DSC1Q08554 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
DSC1Q08554 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DSC1Q08554 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DSC1Q08554 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
DSC1Q08554 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DSC1Q08554 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DSC1Q08554 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
DSC1Q08554 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
DSC1Q08554 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DSC1Q08554 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DSC1Q08554 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DSC1Q08554 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DSC1Q08554 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DSC1Q08554 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DSC1Q08554 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DSC1Q08554 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DSC1Q08554 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DSC1Q08554 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DSC1Q08554 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DSC1Q08554 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DSC1Q08554 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DSC1Q08554 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DSC1Q08554 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DSC1Q08554 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
DSC1Q08554 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms