Protein–RNA interactions for Protein: Q08380

LGALS3BP, Galectin-3-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 585 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGALS3BPQ08380 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LGALS3BPQ08380 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
LGALS3BPQ08380 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LGALS3BPQ08380 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LGALS3BPQ08380 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LGALS3BPQ08380 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LGALS3BPQ08380 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LGALS3BPQ08380 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
LGALS3BPQ08380 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LGALS3BPQ08380 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LGALS3BPQ08380 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LGALS3BPQ08380 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LGALS3BPQ08380 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LGALS3BPQ08380 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LGALS3BPQ08380 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
LGALS3BPQ08380 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LGALS3BPQ08380 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LGALS3BPQ08380 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
LGALS3BPQ08380 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LGALS3BPQ08380 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LGALS3BPQ08380 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LGALS3BPQ08380 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LGALS3BPQ08380 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LGALS3BPQ08380 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LGALS3BPQ08380 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LGALS3BPQ08380 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LGALS3BPQ08380 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
LGALS3BPQ08380 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LGALS3BPQ08380 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LGALS3BPQ08380 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LGALS3BPQ08380 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LGALS3BPQ08380 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LGALS3BPQ08380 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LGALS3BPQ08380 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LGALS3BPQ08380 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LGALS3BPQ08380 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LGALS3BPQ08380 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LGALS3BPQ08380 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LGALS3BPQ08380 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LGALS3BPQ08380 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LGALS3BPQ08380 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LGALS3BPQ08380 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LGALS3BPQ08380 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LGALS3BPQ08380 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LGALS3BPQ08380 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LGALS3BPQ08380 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LGALS3BPQ08380 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LGALS3BPQ08380 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LGALS3BPQ08380 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LGALS3BPQ08380 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LGALS3BPQ08380 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LGALS3BPQ08380 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LGALS3BPQ08380 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LGALS3BPQ08380 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
LGALS3BPQ08380 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LGALS3BPQ08380 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
LGALS3BPQ08380 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LGALS3BPQ08380 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LGALS3BPQ08380 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LGALS3BPQ08380 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LGALS3BPQ08380 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
LGALS3BPQ08380 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
LGALS3BPQ08380 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LGALS3BPQ08380 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LGALS3BPQ08380 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LGALS3BPQ08380 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LGALS3BPQ08380 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LGALS3BPQ08380 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LGALS3BPQ08380 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LGALS3BPQ08380 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LGALS3BPQ08380 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LGALS3BPQ08380 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LGALS3BPQ08380 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LGALS3BPQ08380 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LGALS3BPQ08380 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LGALS3BPQ08380 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LGALS3BPQ08380 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LGALS3BPQ08380 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LGALS3BPQ08380 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LGALS3BPQ08380 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LGALS3BPQ08380 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LGALS3BPQ08380 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LGALS3BPQ08380 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LGALS3BPQ08380 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LGALS3BPQ08380 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LGALS3BPQ08380 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LGALS3BPQ08380 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LGALS3BPQ08380 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LGALS3BPQ08380 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LGALS3BPQ08380 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LGALS3BPQ08380 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LGALS3BPQ08380 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
LGALS3BPQ08380 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
LGALS3BPQ08380 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
LGALS3BPQ08380 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LGALS3BPQ08380 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LGALS3BPQ08380 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LGALS3BPQ08380 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LGALS3BPQ08380 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LGALS3BPQ08380 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms