Protein–RNA interactions for Protein: Q07092

COL16A1, Collagen alpha-1(XVI) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL16A1Q07092 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
COL16A1Q07092 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
COL16A1Q07092 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
COL16A1Q07092 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
COL16A1Q07092 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
COL16A1Q07092 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
COL16A1Q07092 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
COL16A1Q07092 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
COL16A1Q07092 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
COL16A1Q07092 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
COL16A1Q07092 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
COL16A1Q07092 RCAN1-212ENST00000492600 935 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
COL16A1Q07092 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
COL16A1Q07092 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
COL16A1Q07092 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
COL16A1Q07092 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
COL16A1Q07092 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
COL16A1Q07092 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
COL16A1Q07092 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
COL16A1Q07092 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
COL16A1Q07092 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
COL16A1Q07092 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
COL16A1Q07092 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
COL16A1Q07092 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.27
COL16A1Q07092 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
COL16A1Q07092 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
COL16A1Q07092 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
COL16A1Q07092 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
COL16A1Q07092 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
COL16A1Q07092 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
COL16A1Q07092 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
COL16A1Q07092 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
COL16A1Q07092 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
COL16A1Q07092 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
COL16A1Q07092 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
COL16A1Q07092 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
COL16A1Q07092 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
COL16A1Q07092 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
COL16A1Q07092 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
COL16A1Q07092 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
COL16A1Q07092 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
COL16A1Q07092 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
COL16A1Q07092 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
COL16A1Q07092 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
COL16A1Q07092 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
COL16A1Q07092 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
COL16A1Q07092 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
COL16A1Q07092 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
COL16A1Q07092 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
COL16A1Q07092 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
COL16A1Q07092 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
COL16A1Q07092 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
COL16A1Q07092 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
COL16A1Q07092 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
COL16A1Q07092 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
COL16A1Q07092 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
COL16A1Q07092 RETN-203ENST00000629642 400 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
COL16A1Q07092 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
COL16A1Q07092 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
COL16A1Q07092 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
COL16A1Q07092 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
COL16A1Q07092 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
COL16A1Q07092 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
COL16A1Q07092 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
COL16A1Q07092 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
COL16A1Q07092 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
COL16A1Q07092 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
COL16A1Q07092 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
COL16A1Q07092 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
COL16A1Q07092 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
COL16A1Q07092 FAH-201ENST00000261755 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
COL16A1Q07092 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
COL16A1Q07092 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
COL16A1Q07092 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
COL16A1Q07092 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
COL16A1Q07092 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
COL16A1Q07092 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
COL16A1Q07092 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
COL16A1Q07092 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
COL16A1Q07092 AC093904.2-201ENST00000495580 418 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
COL16A1Q07092 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
COL16A1Q07092 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
COL16A1Q07092 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
COL16A1Q07092 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
COL16A1Q07092 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
COL16A1Q07092 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
COL16A1Q07092 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
COL16A1Q07092 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
COL16A1Q07092 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
COL16A1Q07092 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
COL16A1Q07092 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
COL16A1Q07092 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
COL16A1Q07092 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
COL16A1Q07092 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
COL16A1Q07092 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
COL16A1Q07092 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
COL16A1Q07092 AC092506.1-202ENST00000401022 528 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
COL16A1Q07092 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
COL16A1Q07092 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
COL16A1Q07092 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms