Protein–RNA interactions for Protein: Q05D32

CTDSPL2, CTD small phosphatase-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSPL2Q05D32 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CTDSPL2Q05D32 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CTDSPL2Q05D32 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CTDSPL2Q05D32 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
CTDSPL2Q05D32 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CTDSPL2Q05D32 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CTDSPL2Q05D32 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
CTDSPL2Q05D32 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CTDSPL2Q05D32 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CTDSPL2Q05D32 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CTDSPL2Q05D32 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CTDSPL2Q05D32 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CTDSPL2Q05D32 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
CTDSPL2Q05D32 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CTDSPL2Q05D32 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CTDSPL2Q05D32 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CTDSPL2Q05D32 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CTDSPL2Q05D32 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CTDSPL2Q05D32 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CTDSPL2Q05D32 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CTDSPL2Q05D32 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CTDSPL2Q05D32 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CTDSPL2Q05D32 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CTDSPL2Q05D32 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CTDSPL2Q05D32 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CTDSPL2Q05D32 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CTDSPL2Q05D32 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CTDSPL2Q05D32 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CTDSPL2Q05D32 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
CTDSPL2Q05D32 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
CTDSPL2Q05D32 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CTDSPL2Q05D32 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
CTDSPL2Q05D32 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CTDSPL2Q05D32 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CTDSPL2Q05D32 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CTDSPL2Q05D32 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CTDSPL2Q05D32 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CTDSPL2Q05D32 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CTDSPL2Q05D32 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CTDSPL2Q05D32 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CTDSPL2Q05D32 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CTDSPL2Q05D32 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CTDSPL2Q05D32 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CTDSPL2Q05D32 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CTDSPL2Q05D32 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CTDSPL2Q05D32 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CTDSPL2Q05D32 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CTDSPL2Q05D32 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CTDSPL2Q05D32 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CTDSPL2Q05D32 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CTDSPL2Q05D32 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
CTDSPL2Q05D32 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CTDSPL2Q05D32 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CTDSPL2Q05D32 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CTDSPL2Q05D32 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CTDSPL2Q05D32 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CTDSPL2Q05D32 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CTDSPL2Q05D32 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CTDSPL2Q05D32 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
CTDSPL2Q05D32 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CTDSPL2Q05D32 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CTDSPL2Q05D32 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
CTDSPL2Q05D32 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CTDSPL2Q05D32 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CTDSPL2Q05D32 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CTDSPL2Q05D32 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CTDSPL2Q05D32 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CTDSPL2Q05D32 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
CTDSPL2Q05D32 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CTDSPL2Q05D32 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CTDSPL2Q05D32 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CTDSPL2Q05D32 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CTDSPL2Q05D32 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CTDSPL2Q05D32 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CTDSPL2Q05D32 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CTDSPL2Q05D32 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CTDSPL2Q05D32 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CTDSPL2Q05D32 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CTDSPL2Q05D32 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CTDSPL2Q05D32 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CTDSPL2Q05D32 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
CTDSPL2Q05D32 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CTDSPL2Q05D32 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
CTDSPL2Q05D32 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CTDSPL2Q05D32 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CTDSPL2Q05D32 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CTDSPL2Q05D32 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
CTDSPL2Q05D32 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CTDSPL2Q05D32 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CTDSPL2Q05D32 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CTDSPL2Q05D32 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CTDSPL2Q05D32 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CTDSPL2Q05D32 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CTDSPL2Q05D32 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CTDSPL2Q05D32 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CTDSPL2Q05D32 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CTDSPL2Q05D32 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CTDSPL2Q05D32 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CTDSPL2Q05D32 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CTDSPL2Q05D32 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms