Protein–RNA interactions for Protein: Q05209

PTPN12, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN12Q05209 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
PTPN12Q05209 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PTPN12Q05209 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PTPN12Q05209 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PTPN12Q05209 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PTPN12Q05209 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PTPN12Q05209 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PTPN12Q05209 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PTPN12Q05209 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
PTPN12Q05209 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PTPN12Q05209 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PTPN12Q05209 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PTPN12Q05209 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PTPN12Q05209 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PTPN12Q05209 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PTPN12Q05209 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PTPN12Q05209 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTPN12Q05209 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTPN12Q05209 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTPN12Q05209 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTPN12Q05209 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTPN12Q05209 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTPN12Q05209 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTPN12Q05209 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTPN12Q05209 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTPN12Q05209 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
PTPN12Q05209 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTPN12Q05209 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
PTPN12Q05209 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTPN12Q05209 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTPN12Q05209 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
PTPN12Q05209 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
PTPN12Q05209 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTPN12Q05209 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTPN12Q05209 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTPN12Q05209 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTPN12Q05209 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTPN12Q05209 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTPN12Q05209 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTPN12Q05209 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTPN12Q05209 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTPN12Q05209 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTPN12Q05209 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTPN12Q05209 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTPN12Q05209 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTPN12Q05209 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTPN12Q05209 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTPN12Q05209 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTPN12Q05209 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTPN12Q05209 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTPN12Q05209 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTPN12Q05209 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTPN12Q05209 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTPN12Q05209 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTPN12Q05209 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTPN12Q05209 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTPN12Q05209 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTPN12Q05209 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTPN12Q05209 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
PTPN12Q05209 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTPN12Q05209 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTPN12Q05209 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTPN12Q05209 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
PTPN12Q05209 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTPN12Q05209 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTPN12Q05209 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
PTPN12Q05209 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTPN12Q05209 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
PTPN12Q05209 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTPN12Q05209 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTPN12Q05209 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTPN12Q05209 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTPN12Q05209 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTPN12Q05209 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTPN12Q05209 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTPN12Q05209 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTPN12Q05209 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PTPN12Q05209 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PTPN12Q05209 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PTPN12Q05209 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PTPN12Q05209 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
PTPN12Q05209 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PTPN12Q05209 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PTPN12Q05209 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PTPN12Q05209 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
PTPN12Q05209 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
PTPN12Q05209 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PTPN12Q05209 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PTPN12Q05209 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PTPN12Q05209 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PTPN12Q05209 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PTPN12Q05209 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PTPN12Q05209 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PTPN12Q05209 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PTPN12Q05209 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PTPN12Q05209 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
PTPN12Q05209 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
PTPN12Q05209 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PTPN12Q05209 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
PTPN12Q05209 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms