Protein–RNA interactions for Protein: Q03519

TAP2, Antigen peptide transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 686 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAP2Q03519 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TAP2Q03519 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TAP2Q03519 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
TAP2Q03519 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TAP2Q03519 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TAP2Q03519 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TAP2Q03519 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TAP2Q03519 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TAP2Q03519 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TAP2Q03519 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TAP2Q03519 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
TAP2Q03519 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TAP2Q03519 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TAP2Q03519 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
TAP2Q03519 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TAP2Q03519 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TAP2Q03519 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TAP2Q03519 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TAP2Q03519 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TAP2Q03519 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TAP2Q03519 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TAP2Q03519 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TAP2Q03519 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
TAP2Q03519 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TAP2Q03519 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TAP2Q03519 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
TAP2Q03519 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TAP2Q03519 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TAP2Q03519 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TAP2Q03519 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TAP2Q03519 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TAP2Q03519 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TAP2Q03519 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TAP2Q03519 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TAP2Q03519 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TAP2Q03519 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TAP2Q03519 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TAP2Q03519 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TAP2Q03519 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TAP2Q03519 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TAP2Q03519 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TAP2Q03519 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TAP2Q03519 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TAP2Q03519 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TAP2Q03519 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TAP2Q03519 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TAP2Q03519 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TAP2Q03519 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TAP2Q03519 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TAP2Q03519 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TAP2Q03519 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TAP2Q03519 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TAP2Q03519 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TAP2Q03519 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TAP2Q03519 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TAP2Q03519 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TAP2Q03519 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TAP2Q03519 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TAP2Q03519 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TAP2Q03519 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TAP2Q03519 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
TAP2Q03519 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TAP2Q03519 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
TAP2Q03519 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TAP2Q03519 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TAP2Q03519 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TAP2Q03519 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TAP2Q03519 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TAP2Q03519 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
TAP2Q03519 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TAP2Q03519 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TAP2Q03519 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TAP2Q03519 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TAP2Q03519 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TAP2Q03519 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TAP2Q03519 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TAP2Q03519 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TAP2Q03519 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TAP2Q03519 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
TAP2Q03519 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TAP2Q03519 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TAP2Q03519 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TAP2Q03519 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TAP2Q03519 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TAP2Q03519 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TAP2Q03519 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TAP2Q03519 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TAP2Q03519 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TAP2Q03519 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TAP2Q03519 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TAP2Q03519 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TAP2Q03519 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TAP2Q03519 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TAP2Q03519 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TAP2Q03519 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TAP2Q03519 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TAP2Q03519 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TAP2Q03519 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TAP2Q03519 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TAP2Q03519 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms