Protein–RNA interactions for Protein: Q02641

CACNB1, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB1Q02641 RNU4-86P-201ENST00000410135 219 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
CACNB1Q02641 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CACNB1Q02641 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CACNB1Q02641 GNGT1-203ENST00000429473 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CACNB1Q02641 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CACNB1Q02641 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
CACNB1Q02641 POU5F1-202ENST00000441888 1055 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CACNB1Q02641 AP000542.1-201ENST00000448473 371 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
CACNB1Q02641 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CACNB1Q02641 GIN1-203ENST00000508629 1040 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CACNB1Q02641 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CACNB1Q02641 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
CACNB1Q02641 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CACNB1Q02641 CD44-AS1-201ENST00000528869 587 ntTSL 4 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CACNB1Q02641 AL157871.5-201ENST00000555212 533 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CACNB1Q02641 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CACNB1Q02641 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CACNB1Q02641 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CACNB1Q02641 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CACNB1Q02641 AC099654.13-201ENST00000639774 207 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
CACNB1Q02641 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CACNB1Q02641 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CACNB1Q02641 PSMC1P6-201ENST00000477233 1319 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
CACNB1Q02641 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CACNB1Q02641 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CACNB1Q02641 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CACNB1Q02641 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CACNB1Q02641 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CACNB1Q02641 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CACNB1Q02641 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CACNB1Q02641 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CACNB1Q02641 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CACNB1Q02641 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CACNB1Q02641 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CACNB1Q02641 CCL2-201ENST00000225831 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CACNB1Q02641 OR4B1-201ENST00000309562 930 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CACNB1Q02641 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CACNB1Q02641 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CACNB1Q02641 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CACNB1Q02641 OR8V1P-201ENST00000395193 873 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
CACNB1Q02641 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
CACNB1Q02641 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
CACNB1Q02641 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
CACNB1Q02641 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CACNB1Q02641 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CACNB1Q02641 AC023908.1-201ENST00000559899 567 ntTSL 4 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CACNB1Q02641 MIR4719-201ENST00000585233 84 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
CACNB1Q02641 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
CACNB1Q02641 FAM26D-205ENST00000628083 1117 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CACNB1Q02641 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CACNB1Q02641 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CACNB1Q02641 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CACNB1Q02641 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CACNB1Q02641 LMO3-224ENST00000540848 1574 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CACNB1Q02641 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CACNB1Q02641 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CACNB1Q02641 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
CACNB1Q02641 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CACNB1Q02641 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CACNB1Q02641 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
CACNB1Q02641 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CACNB1Q02641 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CACNB1Q02641 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CACNB1Q02641 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CACNB1Q02641 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CACNB1Q02641 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CACNB1Q02641 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CACNB1Q02641 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CACNB1Q02641 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CACNB1Q02641 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CACNB1Q02641 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CACNB1Q02641 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CACNB1Q02641 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CACNB1Q02641 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CACNB1Q02641 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CACNB1Q02641 IL36B-201ENST00000259213 1186 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CACNB1Q02641 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CACNB1Q02641 ZNF738-202ENST00000380870 1142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CACNB1Q02641 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CACNB1Q02641 GTF2IP5-201ENST00000414608 731 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
CACNB1Q02641 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CACNB1Q02641 AP000855.1-201ENST00000433210 636 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CACNB1Q02641 AC007041.1-201ENST00000438989 1155 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
CACNB1Q02641 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CACNB1Q02641 LINC01774-201ENST00000453569 595 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CACNB1Q02641 ASB8-215ENST00000540782 659 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CACNB1Q02641 AP005131.3-201ENST00000590042 665 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CACNB1Q02641 AC006946.3-201ENST00000609791 756 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
CACNB1Q02641 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
CACNB1Q02641 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CACNB1Q02641 AC005393.1-201ENST00000617916 584 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
CACNB1Q02641 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
CACNB1Q02641 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CACNB1Q02641 MAPK10-350ENST00000641777 965 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
CACNB1Q02641 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CACNB1Q02641 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CACNB1Q02641 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CACNB1Q02641 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CACNB1Q02641 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CACNB1Q02641 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.9 ms