Protein–RNA interactions for Protein: Q02556

IRF8, Interferon regulatory factor 8, humanhuman

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF8Q02556 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
IRF8Q02556 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
IRF8Q02556 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
IRF8Q02556 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
IRF8Q02556 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
IRF8Q02556 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
IRF8Q02556 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
IRF8Q02556 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
IRF8Q02556 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
IRF8Q02556 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
IRF8Q02556 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
IRF8Q02556 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
IRF8Q02556 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
IRF8Q02556 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
IRF8Q02556 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
IRF8Q02556 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
IRF8Q02556 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
IRF8Q02556 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
IRF8Q02556 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
IRF8Q02556 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
IRF8Q02556 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
IRF8Q02556 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
IRF8Q02556 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
IRF8Q02556 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
IRF8Q02556 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
IRF8Q02556 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
IRF8Q02556 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
IRF8Q02556 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
IRF8Q02556 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
IRF8Q02556 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
IRF8Q02556 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
IRF8Q02556 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
IRF8Q02556 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
IRF8Q02556 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
IRF8Q02556 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
IRF8Q02556 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
IRF8Q02556 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
IRF8Q02556 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
IRF8Q02556 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
IRF8Q02556 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
IRF8Q02556 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
IRF8Q02556 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
IRF8Q02556 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
IRF8Q02556 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
IRF8Q02556 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
IRF8Q02556 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
IRF8Q02556 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
IRF8Q02556 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
IRF8Q02556 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
IRF8Q02556 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
IRF8Q02556 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
IRF8Q02556 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
IRF8Q02556 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
IRF8Q02556 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
IRF8Q02556 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
IRF8Q02556 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
IRF8Q02556 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
IRF8Q02556 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
IRF8Q02556 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
IRF8Q02556 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
IRF8Q02556 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
IRF8Q02556 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
IRF8Q02556 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
IRF8Q02556 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
IRF8Q02556 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
IRF8Q02556 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
IRF8Q02556 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
IRF8Q02556 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
IRF8Q02556 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
IRF8Q02556 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
IRF8Q02556 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
IRF8Q02556 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
IRF8Q02556 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
IRF8Q02556 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
IRF8Q02556 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
IRF8Q02556 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
IRF8Q02556 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
IRF8Q02556 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
IRF8Q02556 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
IRF8Q02556 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
IRF8Q02556 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
IRF8Q02556 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
IRF8Q02556 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
IRF8Q02556 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
IRF8Q02556 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
IRF8Q02556 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
IRF8Q02556 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
IRF8Q02556 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
IRF8Q02556 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
IRF8Q02556 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
IRF8Q02556 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
IRF8Q02556 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
IRF8Q02556 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
IRF8Q02556 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
IRF8Q02556 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
IRF8Q02556 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
IRF8Q02556 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
IRF8Q02556 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
IRF8Q02556 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
IRF8Q02556 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms