Protein–RNA interactions for Protein: Q00169

PITPNA, Phosphatidylinositol transfer protein alpha isoform, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITPNAQ00169 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PITPNAQ00169 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PITPNAQ00169 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PITPNAQ00169 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PITPNAQ00169 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PITPNAQ00169 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PITPNAQ00169 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PITPNAQ00169 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PITPNAQ00169 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PITPNAQ00169 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PITPNAQ00169 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PITPNAQ00169 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PITPNAQ00169 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PITPNAQ00169 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PITPNAQ00169 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PITPNAQ00169 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PITPNAQ00169 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PITPNAQ00169 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PITPNAQ00169 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PITPNAQ00169 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PITPNAQ00169 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PITPNAQ00169 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PITPNAQ00169 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PITPNAQ00169 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PITPNAQ00169 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PITPNAQ00169 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PITPNAQ00169 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PITPNAQ00169 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PITPNAQ00169 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PITPNAQ00169 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PITPNAQ00169 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PITPNAQ00169 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PITPNAQ00169 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PITPNAQ00169 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PITPNAQ00169 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PITPNAQ00169 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PITPNAQ00169 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PITPNAQ00169 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PITPNAQ00169 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PITPNAQ00169 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PITPNAQ00169 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PITPNAQ00169 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PITPNAQ00169 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PITPNAQ00169 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PITPNAQ00169 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PITPNAQ00169 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PITPNAQ00169 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PITPNAQ00169 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PITPNAQ00169 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PITPNAQ00169 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PITPNAQ00169 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PITPNAQ00169 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PITPNAQ00169 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PITPNAQ00169 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PITPNAQ00169 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PITPNAQ00169 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PITPNAQ00169 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PITPNAQ00169 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PITPNAQ00169 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PITPNAQ00169 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PITPNAQ00169 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PITPNAQ00169 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PITPNAQ00169 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PITPNAQ00169 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PITPNAQ00169 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PITPNAQ00169 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PITPNAQ00169 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
PITPNAQ00169 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PITPNAQ00169 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PITPNAQ00169 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PITPNAQ00169 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PITPNAQ00169 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PITPNAQ00169 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PITPNAQ00169 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PITPNAQ00169 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
PITPNAQ00169 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PITPNAQ00169 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PITPNAQ00169 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PITPNAQ00169 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PITPNAQ00169 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PITPNAQ00169 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PITPNAQ00169 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PITPNAQ00169 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PITPNAQ00169 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PITPNAQ00169 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PITPNAQ00169 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PITPNAQ00169 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PITPNAQ00169 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PITPNAQ00169 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PITPNAQ00169 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PITPNAQ00169 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PITPNAQ00169 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
PITPNAQ00169 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PITPNAQ00169 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PITPNAQ00169 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PITPNAQ00169 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PITPNAQ00169 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PITPNAQ00169 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PITPNAQ00169 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PITPNAQ00169 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms