Protein–RNA interactions for Protein: P80217

IFI35, Interferon-induced 35 kDa protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFI35P80217 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
IFI35P80217 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
IFI35P80217 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
IFI35P80217 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
IFI35P80217 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
IFI35P80217 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
IFI35P80217 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
IFI35P80217 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
IFI35P80217 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
IFI35P80217 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
IFI35P80217 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
IFI35P80217 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
IFI35P80217 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
IFI35P80217 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
IFI35P80217 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
IFI35P80217 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
IFI35P80217 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
IFI35P80217 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
IFI35P80217 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
IFI35P80217 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
IFI35P80217 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
IFI35P80217 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
IFI35P80217 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
IFI35P80217 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
IFI35P80217 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
IFI35P80217 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
IFI35P80217 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
IFI35P80217 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
IFI35P80217 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
IFI35P80217 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
IFI35P80217 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC18■□□□□ 0.47
IFI35P80217 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
IFI35P80217 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
IFI35P80217 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
IFI35P80217 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
IFI35P80217 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
IFI35P80217 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
IFI35P80217 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
IFI35P80217 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC18■□□□□ 0.47
IFI35P80217 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
IFI35P80217 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
IFI35P80217 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
IFI35P80217 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
IFI35P80217 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
IFI35P80217 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
IFI35P80217 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
IFI35P80217 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
IFI35P80217 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
IFI35P80217 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
IFI35P80217 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
IFI35P80217 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
IFI35P80217 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
IFI35P80217 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
IFI35P80217 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
IFI35P80217 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
IFI35P80217 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
IFI35P80217 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
IFI35P80217 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
IFI35P80217 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
IFI35P80217 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
IFI35P80217 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
IFI35P80217 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
IFI35P80217 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
IFI35P80217 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
IFI35P80217 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
IFI35P80217 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
IFI35P80217 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
IFI35P80217 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
IFI35P80217 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
IFI35P80217 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
IFI35P80217 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
IFI35P80217 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
IFI35P80217 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
IFI35P80217 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
IFI35P80217 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
IFI35P80217 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
IFI35P80217 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
IFI35P80217 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
IFI35P80217 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
IFI35P80217 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
IFI35P80217 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
IFI35P80217 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
IFI35P80217 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
IFI35P80217 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
IFI35P80217 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
IFI35P80217 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
IFI35P80217 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
IFI35P80217 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
IFI35P80217 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
IFI35P80217 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
IFI35P80217 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
IFI35P80217 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
IFI35P80217 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
IFI35P80217 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
IFI35P80217 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
IFI35P80217 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
IFI35P80217 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
IFI35P80217 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
IFI35P80217 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
IFI35P80217 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms