Protein–RNA interactions for Protein: P68871

HBB, Hemoglobin subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HBBP68871 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
HBBP68871 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
HBBP68871 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
HBBP68871 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
HBBP68871 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
HBBP68871 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
HBBP68871 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
HBBP68871 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
HBBP68871 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
HBBP68871 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
HBBP68871 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
HBBP68871 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
HBBP68871 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
HBBP68871 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
HBBP68871 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
HBBP68871 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
HBBP68871 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
HBBP68871 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
HBBP68871 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
HBBP68871 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
HBBP68871 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
HBBP68871 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
HBBP68871 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
HBBP68871 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
HBBP68871 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
HBBP68871 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
HBBP68871 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
HBBP68871 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
HBBP68871 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
HBBP68871 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
HBBP68871 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
HBBP68871 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
HBBP68871 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
HBBP68871 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
HBBP68871 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
HBBP68871 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
HBBP68871 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
HBBP68871 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
HBBP68871 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
HBBP68871 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
HBBP68871 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
HBBP68871 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
HBBP68871 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
HBBP68871 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
HBBP68871 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
HBBP68871 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC12.92□□□□□ -0.34
HBBP68871 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
HBBP68871 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
HBBP68871 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
HBBP68871 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
HBBP68871 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
HBBP68871 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
HBBP68871 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
HBBP68871 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
HBBP68871 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
HBBP68871 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
HBBP68871 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
HBBP68871 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
HBBP68871 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
HBBP68871 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
HBBP68871 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
HBBP68871 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
HBBP68871 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
HBBP68871 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
HBBP68871 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
HBBP68871 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
HBBP68871 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
HBBP68871 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
HBBP68871 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
HBBP68871 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
HBBP68871 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
HBBP68871 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
HBBP68871 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
HBBP68871 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
HBBP68871 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
HBBP68871 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
HBBP68871 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
HBBP68871 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
HBBP68871 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
HBBP68871 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
HBBP68871 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
HBBP68871 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
HBBP68871 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
HBBP68871 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
HBBP68871 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
HBBP68871 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
HBBP68871 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
HBBP68871 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
HBBP68871 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
HBBP68871 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
HBBP68871 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
HBBP68871 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
HBBP68871 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
HBBP68871 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
HBBP68871 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
HBBP68871 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
HBBP68871 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
HBBP68871 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
HBBP68871 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
HBBP68871 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms