Protein–RNA interactions for Protein: P62834

RAP1A, Ras-related protein Rap-1A, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAP1AP62834 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAP1AP62834 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAP1AP62834 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAP1AP62834 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAP1AP62834 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RAP1AP62834 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAP1AP62834 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAP1AP62834 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAP1AP62834 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAP1AP62834 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAP1AP62834 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAP1AP62834 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAP1AP62834 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RAP1AP62834 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAP1AP62834 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAP1AP62834 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAP1AP62834 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAP1AP62834 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAP1AP62834 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAP1AP62834 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAP1AP62834 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RAP1AP62834 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAP1AP62834 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAP1AP62834 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAP1AP62834 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAP1AP62834 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAP1AP62834 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAP1AP62834 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAP1AP62834 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAP1AP62834 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAP1AP62834 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAP1AP62834 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAP1AP62834 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAP1AP62834 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAP1AP62834 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAP1AP62834 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAP1AP62834 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAP1AP62834 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAP1AP62834 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAP1AP62834 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAP1AP62834 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAP1AP62834 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RAP1AP62834 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAP1AP62834 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAP1AP62834 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAP1AP62834 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RAP1AP62834 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAP1AP62834 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAP1AP62834 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAP1AP62834 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAP1AP62834 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAP1AP62834 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAP1AP62834 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAP1AP62834 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAP1AP62834 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAP1AP62834 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAP1AP62834 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAP1AP62834 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAP1AP62834 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAP1AP62834 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RAP1AP62834 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RAP1AP62834 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAP1AP62834 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAP1AP62834 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RAP1AP62834 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAP1AP62834 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAP1AP62834 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAP1AP62834 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAP1AP62834 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAP1AP62834 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAP1AP62834 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAP1AP62834 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAP1AP62834 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAP1AP62834 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAP1AP62834 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAP1AP62834 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAP1AP62834 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAP1AP62834 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAP1AP62834 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAP1AP62834 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAP1AP62834 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAP1AP62834 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAP1AP62834 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAP1AP62834 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAP1AP62834 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAP1AP62834 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAP1AP62834 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAP1AP62834 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAP1AP62834 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAP1AP62834 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAP1AP62834 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
RAP1AP62834 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAP1AP62834 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAP1AP62834 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
RAP1AP62834 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAP1AP62834 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAP1AP62834 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAP1AP62834 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAP1AP62834 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAP1AP62834 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.9 ms