Protein–RNA interactions for Protein: P61758

VBP1, Prefoldin subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VBP1P61758 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
VBP1P61758 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
VBP1P61758 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
VBP1P61758 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
VBP1P61758 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
VBP1P61758 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
VBP1P61758 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
VBP1P61758 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
VBP1P61758 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VBP1P61758 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VBP1P61758 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VBP1P61758 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VBP1P61758 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VBP1P61758 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VBP1P61758 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VBP1P61758 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
VBP1P61758 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
VBP1P61758 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VBP1P61758 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VBP1P61758 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VBP1P61758 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VBP1P61758 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VBP1P61758 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VBP1P61758 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
VBP1P61758 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
VBP1P61758 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
VBP1P61758 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VBP1P61758 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VBP1P61758 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VBP1P61758 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VBP1P61758 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VBP1P61758 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VBP1P61758 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VBP1P61758 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VBP1P61758 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VBP1P61758 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VBP1P61758 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VBP1P61758 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VBP1P61758 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VBP1P61758 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VBP1P61758 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VBP1P61758 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VBP1P61758 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VBP1P61758 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
VBP1P61758 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VBP1P61758 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VBP1P61758 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VBP1P61758 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VBP1P61758 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VBP1P61758 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VBP1P61758 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VBP1P61758 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VBP1P61758 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VBP1P61758 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VBP1P61758 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VBP1P61758 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VBP1P61758 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VBP1P61758 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VBP1P61758 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VBP1P61758 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VBP1P61758 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VBP1P61758 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VBP1P61758 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VBP1P61758 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VBP1P61758 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VBP1P61758 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VBP1P61758 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VBP1P61758 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VBP1P61758 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VBP1P61758 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VBP1P61758 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VBP1P61758 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VBP1P61758 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VBP1P61758 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VBP1P61758 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VBP1P61758 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VBP1P61758 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VBP1P61758 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
VBP1P61758 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VBP1P61758 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VBP1P61758 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VBP1P61758 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VBP1P61758 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VBP1P61758 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VBP1P61758 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VBP1P61758 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VBP1P61758 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VBP1P61758 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VBP1P61758 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VBP1P61758 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VBP1P61758 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VBP1P61758 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VBP1P61758 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VBP1P61758 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VBP1P61758 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VBP1P61758 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VBP1P61758 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VBP1P61758 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VBP1P61758 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VBP1P61758 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms