Protein–RNA interactions for Protein: P60509

ERVPABLB-1, Endogenous retrovirus group PABLB member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVPABLB-1P60509 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ERVPABLB-1P60509 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ERVPABLB-1P60509 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ERVPABLB-1P60509 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ERVPABLB-1P60509 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ERVPABLB-1P60509 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ERVPABLB-1P60509 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
ERVPABLB-1P60509 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ERVPABLB-1P60509 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ERVPABLB-1P60509 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ERVPABLB-1P60509 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
ERVPABLB-1P60509 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
ERVPABLB-1P60509 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ERVPABLB-1P60509 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ERVPABLB-1P60509 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ERVPABLB-1P60509 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ERVPABLB-1P60509 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ERVPABLB-1P60509 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ERVPABLB-1P60509 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ERVPABLB-1P60509 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ERVPABLB-1P60509 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ERVPABLB-1P60509 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ERVPABLB-1P60509 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ERVPABLB-1P60509 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ERVPABLB-1P60509 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ERVPABLB-1P60509 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ERVPABLB-1P60509 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ERVPABLB-1P60509 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ERVPABLB-1P60509 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ERVPABLB-1P60509 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ERVPABLB-1P60509 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
ERVPABLB-1P60509 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ERVPABLB-1P60509 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ERVPABLB-1P60509 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ERVPABLB-1P60509 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ERVPABLB-1P60509 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ERVPABLB-1P60509 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ERVPABLB-1P60509 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ERVPABLB-1P60509 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ERVPABLB-1P60509 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ERVPABLB-1P60509 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ERVPABLB-1P60509 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ERVPABLB-1P60509 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ERVPABLB-1P60509 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ERVPABLB-1P60509 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ERVPABLB-1P60509 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ERVPABLB-1P60509 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ERVPABLB-1P60509 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ERVPABLB-1P60509 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ERVPABLB-1P60509 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ERVPABLB-1P60509 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
ERVPABLB-1P60509 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
ERVPABLB-1P60509 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ERVPABLB-1P60509 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ERVPABLB-1P60509 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
ERVPABLB-1P60509 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ERVPABLB-1P60509 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ERVPABLB-1P60509 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ERVPABLB-1P60509 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ERVPABLB-1P60509 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ERVPABLB-1P60509 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ERVPABLB-1P60509 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ERVPABLB-1P60509 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ERVPABLB-1P60509 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ERVPABLB-1P60509 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ERVPABLB-1P60509 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ERVPABLB-1P60509 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ERVPABLB-1P60509 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ERVPABLB-1P60509 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ERVPABLB-1P60509 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ERVPABLB-1P60509 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ERVPABLB-1P60509 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ERVPABLB-1P60509 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ERVPABLB-1P60509 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
ERVPABLB-1P60509 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ERVPABLB-1P60509 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ERVPABLB-1P60509 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ERVPABLB-1P60509 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ERVPABLB-1P60509 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ERVPABLB-1P60509 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ERVPABLB-1P60509 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ERVPABLB-1P60509 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
ERVPABLB-1P60509 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ERVPABLB-1P60509 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ERVPABLB-1P60509 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ERVPABLB-1P60509 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
ERVPABLB-1P60509 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ERVPABLB-1P60509 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ERVPABLB-1P60509 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ERVPABLB-1P60509 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ERVPABLB-1P60509 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ERVPABLB-1P60509 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ERVPABLB-1P60509 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ERVPABLB-1P60509 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ERVPABLB-1P60509 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ERVPABLB-1P60509 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ERVPABLB-1P60509 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ERVPABLB-1P60509 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ERVPABLB-1P60509 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ERVPABLB-1P60509 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms