Protein–RNA interactions for Protein: P57075

UBASH3A, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein A, humanhuman

Predictions only

Length 661 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBASH3AP57075 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
UBASH3AP57075 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
UBASH3AP57075 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
UBASH3AP57075 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
UBASH3AP57075 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
UBASH3AP57075 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
UBASH3AP57075 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
UBASH3AP57075 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
UBASH3AP57075 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
UBASH3AP57075 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
UBASH3AP57075 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
UBASH3AP57075 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
UBASH3AP57075 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
UBASH3AP57075 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
UBASH3AP57075 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
UBASH3AP57075 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
UBASH3AP57075 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
UBASH3AP57075 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
UBASH3AP57075 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
UBASH3AP57075 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
UBASH3AP57075 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
UBASH3AP57075 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
UBASH3AP57075 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
UBASH3AP57075 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
UBASH3AP57075 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
UBASH3AP57075 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
UBASH3AP57075 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
UBASH3AP57075 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
UBASH3AP57075 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
UBASH3AP57075 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
UBASH3AP57075 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
UBASH3AP57075 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
UBASH3AP57075 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
UBASH3AP57075 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
UBASH3AP57075 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
UBASH3AP57075 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
UBASH3AP57075 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
UBASH3AP57075 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
UBASH3AP57075 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
UBASH3AP57075 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
UBASH3AP57075 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
UBASH3AP57075 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
UBASH3AP57075 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
UBASH3AP57075 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
UBASH3AP57075 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
UBASH3AP57075 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
UBASH3AP57075 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
UBASH3AP57075 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
UBASH3AP57075 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
UBASH3AP57075 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
UBASH3AP57075 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
UBASH3AP57075 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
UBASH3AP57075 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
UBASH3AP57075 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
UBASH3AP57075 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
UBASH3AP57075 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
UBASH3AP57075 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
UBASH3AP57075 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
UBASH3AP57075 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
UBASH3AP57075 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
UBASH3AP57075 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
UBASH3AP57075 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
UBASH3AP57075 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
UBASH3AP57075 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
UBASH3AP57075 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
UBASH3AP57075 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
UBASH3AP57075 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
UBASH3AP57075 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
UBASH3AP57075 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
UBASH3AP57075 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
UBASH3AP57075 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
UBASH3AP57075 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
UBASH3AP57075 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
UBASH3AP57075 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
UBASH3AP57075 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
UBASH3AP57075 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
UBASH3AP57075 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
UBASH3AP57075 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
UBASH3AP57075 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
UBASH3AP57075 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
UBASH3AP57075 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
UBASH3AP57075 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
UBASH3AP57075 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
UBASH3AP57075 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
UBASH3AP57075 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
UBASH3AP57075 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
UBASH3AP57075 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
UBASH3AP57075 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
UBASH3AP57075 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
UBASH3AP57075 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
UBASH3AP57075 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
UBASH3AP57075 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
UBASH3AP57075 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
UBASH3AP57075 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
UBASH3AP57075 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
UBASH3AP57075 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
UBASH3AP57075 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
UBASH3AP57075 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
UBASH3AP57075 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
UBASH3AP57075 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms