Protein–RNA interactions for Protein: P56597

NME5, Nucleoside diphosphate kinase homolog 5, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME5P56597 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NME5P56597 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NME5P56597 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NME5P56597 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NME5P56597 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NME5P56597 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NME5P56597 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NME5P56597 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
NME5P56597 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NME5P56597 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NME5P56597 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NME5P56597 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NME5P56597 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NME5P56597 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NME5P56597 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NME5P56597 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NME5P56597 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
NME5P56597 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NME5P56597 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NME5P56597 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
NME5P56597 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NME5P56597 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
NME5P56597 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
NME5P56597 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NME5P56597 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NME5P56597 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NME5P56597 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NME5P56597 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NME5P56597 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NME5P56597 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NME5P56597 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NME5P56597 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NME5P56597 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NME5P56597 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NME5P56597 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NME5P56597 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NME5P56597 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NME5P56597 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NME5P56597 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NME5P56597 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NME5P56597 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NME5P56597 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NME5P56597 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NME5P56597 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NME5P56597 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NME5P56597 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NME5P56597 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NME5P56597 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NME5P56597 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NME5P56597 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NME5P56597 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NME5P56597 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NME5P56597 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NME5P56597 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NME5P56597 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NME5P56597 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NME5P56597 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NME5P56597 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NME5P56597 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NME5P56597 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NME5P56597 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
NME5P56597 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
NME5P56597 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NME5P56597 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
NME5P56597 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NME5P56597 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NME5P56597 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NME5P56597 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NME5P56597 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NME5P56597 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
NME5P56597 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NME5P56597 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NME5P56597 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NME5P56597 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NME5P56597 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NME5P56597 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NME5P56597 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NME5P56597 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NME5P56597 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NME5P56597 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NME5P56597 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
NME5P56597 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
NME5P56597 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NME5P56597 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NME5P56597 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NME5P56597 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NME5P56597 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NME5P56597 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NME5P56597 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NME5P56597 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NME5P56597 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NME5P56597 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NME5P56597 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NME5P56597 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NME5P56597 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NME5P56597 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NME5P56597 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NME5P56597 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NME5P56597 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
NME5P56597 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms