Protein–RNA interactions for Protein: P55895

RAG2, V(D)J recombination-activating protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAG2P55895 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RAG2P55895 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RAG2P55895 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RAG2P55895 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RAG2P55895 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC15.04■□□□□ -0
RAG2P55895 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RAG2P55895 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RAG2P55895 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RAG2P55895 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RAG2P55895 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC15.04■□□□□ -0
RAG2P55895 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC15.04■□□□□ -0
RAG2P55895 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC15.04■□□□□ -0
RAG2P55895 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
RAG2P55895 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
RAG2P55895 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
RAG2P55895 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RAG2P55895 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RAG2P55895 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RAG2P55895 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
RAG2P55895 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC15.04■□□□□ -0
RAG2P55895 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RAG2P55895 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RAG2P55895 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RAG2P55895 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RAG2P55895 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RAG2P55895 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RAG2P55895 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RAG2P55895 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RAG2P55895 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RAG2P55895 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC15.04■□□□□ -0
RAG2P55895 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RAG2P55895 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RAG2P55895 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RAG2P55895 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RAG2P55895 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RAG2P55895 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RAG2P55895 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RAG2P55895 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RAG2P55895 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RAG2P55895 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC15.03■□□□□ -0
RAG2P55895 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RAG2P55895 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RAG2P55895 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC15.03■□□□□ -0
RAG2P55895 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RAG2P55895 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RAG2P55895 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RAG2P55895 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RAG2P55895 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RAG2P55895 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RAG2P55895 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RAG2P55895 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RAG2P55895 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RAG2P55895 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RAG2P55895 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RAG2P55895 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RAG2P55895 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC15.03■□□□□ -0
RAG2P55895 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RAG2P55895 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RAG2P55895 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RAG2P55895 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RAG2P55895 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RAG2P55895 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RAG2P55895 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
RAG2P55895 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
RAG2P55895 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
RAG2P55895 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
RAG2P55895 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RAG2P55895 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
RAG2P55895 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC15.03■□□□□ -0
RAG2P55895 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RAG2P55895 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RAG2P55895 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RAG2P55895 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RAG2P55895 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RAG2P55895 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RAG2P55895 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RAG2P55895 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RAG2P55895 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RAG2P55895 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RAG2P55895 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RAG2P55895 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RAG2P55895 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RAG2P55895 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RAG2P55895 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RAG2P55895 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RAG2P55895 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RAG2P55895 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
RAG2P55895 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RAG2P55895 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
RAG2P55895 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RAG2P55895 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RAG2P55895 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
RAG2P55895 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
RAG2P55895 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
RAG2P55895 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
RAG2P55895 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RAG2P55895 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RAG2P55895 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
RAG2P55895 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RAG2P55895 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms