Protein–RNA interactions for Protein: P55212

CASP6, Caspase-6, humanhuman

Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP6P55212 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CASP6P55212 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CASP6P55212 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CASP6P55212 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CASP6P55212 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CASP6P55212 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CASP6P55212 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CASP6P55212 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CASP6P55212 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CASP6P55212 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CASP6P55212 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CASP6P55212 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CASP6P55212 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CASP6P55212 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CASP6P55212 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CASP6P55212 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CASP6P55212 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CASP6P55212 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CASP6P55212 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CASP6P55212 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CASP6P55212 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CASP6P55212 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CASP6P55212 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CASP6P55212 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CASP6P55212 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CASP6P55212 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CASP6P55212 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CASP6P55212 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CASP6P55212 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CASP6P55212 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CASP6P55212 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CASP6P55212 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CASP6P55212 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CASP6P55212 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CASP6P55212 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CASP6P55212 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CASP6P55212 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CASP6P55212 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CASP6P55212 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CASP6P55212 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CASP6P55212 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CASP6P55212 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CASP6P55212 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CASP6P55212 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CASP6P55212 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CASP6P55212 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CASP6P55212 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CASP6P55212 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CASP6P55212 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CASP6P55212 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CASP6P55212 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CASP6P55212 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CASP6P55212 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CASP6P55212 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CASP6P55212 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CASP6P55212 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CASP6P55212 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CASP6P55212 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CASP6P55212 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CASP6P55212 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CASP6P55212 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CASP6P55212 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CASP6P55212 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CASP6P55212 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CASP6P55212 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CASP6P55212 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CASP6P55212 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CASP6P55212 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CASP6P55212 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CASP6P55212 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CASP6P55212 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CASP6P55212 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CASP6P55212 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CASP6P55212 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CASP6P55212 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CASP6P55212 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CASP6P55212 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CASP6P55212 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CASP6P55212 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CASP6P55212 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CASP6P55212 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CASP6P55212 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CASP6P55212 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CASP6P55212 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CASP6P55212 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CASP6P55212 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CASP6P55212 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CASP6P55212 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CASP6P55212 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CASP6P55212 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CASP6P55212 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CASP6P55212 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CASP6P55212 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CASP6P55212 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CASP6P55212 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CASP6P55212 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CASP6P55212 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CASP6P55212 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
CASP6P55212 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CASP6P55212 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms