Protein–RNA interactions for Protein: P52951

GBX2, Homeobox protein GBX-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBX2P52951 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GBX2P52951 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GBX2P52951 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
GBX2P52951 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GBX2P52951 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
GBX2P52951 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
GBX2P52951 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GBX2P52951 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GBX2P52951 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GBX2P52951 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GBX2P52951 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GBX2P52951 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GBX2P52951 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GBX2P52951 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GBX2P52951 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GBX2P52951 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GBX2P52951 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GBX2P52951 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GBX2P52951 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GBX2P52951 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GBX2P52951 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GBX2P52951 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GBX2P52951 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
GBX2P52951 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
GBX2P52951 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
GBX2P52951 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
GBX2P52951 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
GBX2P52951 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GBX2P52951 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GBX2P52951 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GBX2P52951 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GBX2P52951 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GBX2P52951 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GBX2P52951 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GBX2P52951 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GBX2P52951 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GBX2P52951 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GBX2P52951 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GBX2P52951 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GBX2P52951 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
GBX2P52951 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GBX2P52951 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GBX2P52951 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GBX2P52951 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GBX2P52951 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GBX2P52951 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GBX2P52951 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GBX2P52951 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GBX2P52951 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GBX2P52951 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GBX2P52951 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GBX2P52951 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GBX2P52951 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GBX2P52951 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GBX2P52951 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GBX2P52951 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GBX2P52951 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GBX2P52951 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
GBX2P52951 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GBX2P52951 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GBX2P52951 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GBX2P52951 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GBX2P52951 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GBX2P52951 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
GBX2P52951 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GBX2P52951 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GBX2P52951 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GBX2P52951 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GBX2P52951 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GBX2P52951 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GBX2P52951 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GBX2P52951 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GBX2P52951 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GBX2P52951 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GBX2P52951 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GBX2P52951 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GBX2P52951 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GBX2P52951 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GBX2P52951 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
GBX2P52951 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GBX2P52951 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GBX2P52951 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GBX2P52951 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GBX2P52951 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GBX2P52951 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GBX2P52951 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GBX2P52951 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GBX2P52951 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GBX2P52951 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GBX2P52951 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GBX2P52951 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GBX2P52951 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GBX2P52951 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GBX2P52951 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GBX2P52951 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
GBX2P52951 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GBX2P52951 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GBX2P52951 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GBX2P52951 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
GBX2P52951 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms