Protein–RNA interactions for Protein: P52209

PGD, 6-phosphogluconate dehydrogenase, decarboxylating, humanhuman

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGDP52209 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PGDP52209 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PGDP52209 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PGDP52209 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PGDP52209 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PGDP52209 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PGDP52209 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PGDP52209 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PGDP52209 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PGDP52209 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PGDP52209 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
PGDP52209 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
PGDP52209 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PGDP52209 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PGDP52209 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PGDP52209 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
PGDP52209 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PGDP52209 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PGDP52209 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
PGDP52209 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PGDP52209 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PGDP52209 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PGDP52209 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PGDP52209 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PGDP52209 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PGDP52209 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PGDP52209 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PGDP52209 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PGDP52209 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PGDP52209 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PGDP52209 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PGDP52209 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PGDP52209 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PGDP52209 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
PGDP52209 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PGDP52209 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PGDP52209 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PGDP52209 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PGDP52209 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PGDP52209 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PGDP52209 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PGDP52209 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PGDP52209 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PGDP52209 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PGDP52209 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PGDP52209 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PGDP52209 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PGDP52209 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PGDP52209 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PGDP52209 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PGDP52209 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PGDP52209 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PGDP52209 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PGDP52209 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PGDP52209 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
PGDP52209 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PGDP52209 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PGDP52209 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PGDP52209 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PGDP52209 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PGDP52209 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PGDP52209 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PGDP52209 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PGDP52209 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PGDP52209 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PGDP52209 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PGDP52209 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
PGDP52209 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
PGDP52209 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
PGDP52209 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
PGDP52209 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PGDP52209 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PGDP52209 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PGDP52209 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PGDP52209 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PGDP52209 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PGDP52209 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PGDP52209 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PGDP52209 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PGDP52209 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PGDP52209 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PGDP52209 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PGDP52209 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PGDP52209 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PGDP52209 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PGDP52209 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PGDP52209 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PGDP52209 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
PGDP52209 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
PGDP52209 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PGDP52209 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PGDP52209 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
PGDP52209 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
PGDP52209 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PGDP52209 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PGDP52209 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
PGDP52209 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PGDP52209 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PGDP52209 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PGDP52209 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms